46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3227 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  56.06 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  63.72 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  54.87 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  34.45 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  33.93 
 
 		 1046 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  33.59 
 
 		 1063 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  35.14 
 
 		 756 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  37.29 
 
 		 765 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  37.62 
 
 		 465 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  35.19 
 
 		 772 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  34.26 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  32.41 
 
 		 1091 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  30.19 
 
 		 917 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  37.25 
 
 		 963 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  33.04 
 
 		 1737 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  31.25 
 
 		 503 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  31.78 
 
 		 911 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  33.64 
 
 		 776 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.33 
 
 		 507 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  31.43 
 
 		 468 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  28.3 
 
 		 924 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  30.09 
 
 		 1013 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  34.58 
 
 		 1066 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  32.41 
 
 		 922 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  32.43 
 
 		 724 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  28.7 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  31.78 
 
 		 646 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  31.31 
 
 		 768 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  28.37 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  34.58 
 
 		 1182 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  29.91 
 
 		 785 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  37.14 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  29.91 
 
 		 1171 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  27.18 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  29.41 
 
 		 1129 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1074 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  30.84 
 
 		 1067 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  31.37 
 
 		 729 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  27.45 
 
 		 922 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  26.45 
 
 		 984 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  31.68 
 
 		 1097 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  27.1 
 
 		 677 aa  42  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  24.76 
 
 		 841 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 		 651 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  34.67 
 
 		 299 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>