68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2715 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  48.69 
 
 
924 aa  877    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  45.7 
 
 
917 aa  813    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
911 aa  1897    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  44.68 
 
 
922 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  43.04 
 
 
1171 aa  315  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  46.2 
 
 
1068 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  46.63 
 
 
1066 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  42.35 
 
 
776 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  44.29 
 
 
1182 aa  296  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  41.36 
 
 
1063 aa  293  9e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  42.32 
 
 
772 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  45.48 
 
 
1074 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  39.94 
 
 
765 aa  290  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  41.04 
 
 
1013 aa  285  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  38.94 
 
 
1046 aa  281  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  39.42 
 
 
1074 aa  281  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  43.36 
 
 
1091 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  35.93 
 
 
1067 aa  255  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  39.73 
 
 
888 aa  233  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  34.55 
 
 
883 aa  206  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  33.76 
 
 
963 aa  200  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  31.42 
 
 
922 aa  198  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  33.07 
 
 
1097 aa  198  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  28.23 
 
 
805 aa  193  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  42.68 
 
 
782 aa  189  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  40.77 
 
 
792 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  31.97 
 
 
984 aa  178  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  30.37 
 
 
1129 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  26.55 
 
 
841 aa  122  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  28.28 
 
 
785 aa  121  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  26.82 
 
 
768 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  26.32 
 
 
759 aa  92  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  24.61 
 
 
626 aa  87  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  27.88 
 
 
833 aa  87.4  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  22.94 
 
 
725 aa  80.9  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  35.05 
 
 
1737 aa  78.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  22.94 
 
 
893 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  32.67 
 
 
147 aa  64.7  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  29.94 
 
 
646 aa  64.3  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  22.32 
 
 
1178 aa  62.4  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  30.33 
 
 
124 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  22.91 
 
 
998 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  30.36 
 
 
918 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  30.56 
 
 
724 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  36.27 
 
 
465 aa  55.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  31.78 
 
 
131 aa  55.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  33.33 
 
 
129 aa  53.9  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  21.78 
 
 
565 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  34.83 
 
 
503 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  34.41 
 
 
468 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  29.09 
 
 
729 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  27.48 
 
 
1142 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  28.23 
 
 
132 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  26.98 
 
 
132 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  23.08 
 
 
524 aa  50.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  32.58 
 
 
507 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  27.71 
 
 
562 aa  48.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  26.09 
 
 
136 aa  48.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 
509 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  32.58 
 
 
299 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  26.79 
 
 
1164 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  30 
 
 
716 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  27.12 
 
 
1151 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  30.09 
 
 
928 aa  46.2  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  26.04 
 
 
756 aa  45.8  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  25.93 
 
 
137 aa  44.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  26.73 
 
 
965 aa  44.3  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  31.11 
 
 
251 aa  44.3  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>