58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2165 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
963 aa  1990    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  30.58 
 
 
984 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  29.04 
 
 
922 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  41.5 
 
 
1097 aa  289  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  39.44 
 
 
922 aa  264  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  38.39 
 
 
1129 aa  261  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  37.97 
 
 
1046 aa  253  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  35.22 
 
 
1091 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  36.21 
 
 
1066 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  37.17 
 
 
776 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  32.54 
 
 
883 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  36.52 
 
 
1068 aa  231  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  36.36 
 
 
1074 aa  231  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  35.46 
 
 
772 aa  229  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  37.57 
 
 
765 aa  224  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  36.21 
 
 
1063 aa  221  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  32.3 
 
 
805 aa  217  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  36.34 
 
 
1182 aa  217  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  35.99 
 
 
1074 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  35.12 
 
 
924 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  35.31 
 
 
1013 aa  209  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  34.07 
 
 
917 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  33.18 
 
 
911 aa  200  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  29.91 
 
 
1067 aa  196  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  38.33 
 
 
782 aa  191  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  33.61 
 
 
1171 aa  187  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  42.86 
 
 
792 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  34.57 
 
 
888 aa  177  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  27.25 
 
 
768 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  24.32 
 
 
841 aa  112  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  24.51 
 
 
785 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.65 
 
 
1737 aa  92.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  35.71 
 
 
147 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  24.76 
 
 
759 aa  89.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  26.13 
 
 
833 aa  85.9  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  27.82 
 
 
626 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
1178 aa  79.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  27.8 
 
 
893 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  23.88 
 
 
725 aa  73.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  39.25 
 
 
507 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  24.77 
 
 
565 aa  68.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  36.36 
 
 
503 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  22.73 
 
 
998 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  34.58 
 
 
468 aa  61.6  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  27.5 
 
 
756 aa  61.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  29.37 
 
 
562 aa  56.2  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  37.25 
 
 
131 aa  56.2  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  32.04 
 
 
132 aa  55.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  35.92 
 
 
136 aa  55.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  30.09 
 
 
729 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  28.91 
 
 
724 aa  52.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  34.07 
 
 
651 aa  50.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  24.73 
 
 
465 aa  50.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  32.69 
 
 
132 aa  48.9  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  27.17 
 
 
646 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  31.43 
 
 
818 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  25.71 
 
 
716 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0161  hypothetical protein  30.77 
 
 
171 aa  44.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>