172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2885 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  75.57 
 
 		 998 aa  1524    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 991 aa  2010    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1512 aa  332  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1416 aa  327  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  36.16 
 
 		 2001 aa  122  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  36.07 
 
 		 3197 aa  103  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.07 
 
 		 3363 aa  101  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  39.29 
 
 		 16311 aa  96.3  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 4978 aa  95.1  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.52 
 
 		 994 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  36.11 
 
 		 3197 aa  89.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  40.26 
 
 		 1055 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  29.93 
 
 		 6276 aa  87.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.61 
 
 		 2145 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  38.01 
 
 		 2060 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  41.36 
 
 		 2567 aa  82.8  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.37 
 
 		 11716 aa  82.8  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.76 
 
 		 2678 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  42.2 
 
 		 2132 aa  81.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.65 
 
 		 4848 aa  77.8  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  36.46 
 
 		 5769 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.92 
 
 		 850 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.7 
 
 		 3927 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  25.05 
 
 		 2074 aa  77  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  29.03 
 
 		 2169 aa  75.5  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.64 
 
 		 4231 aa  73.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  30.54 
 
 		 2461 aa  72  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.69 
 
 		 1706 aa  71.6  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.28 
 
 		 3699 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  30.95 
 
 		 2153 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.28 
 
 		 2503 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.78 
 
 		 735 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  31.4 
 
 		 2816 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.75 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.75 
 
 		 3699 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  31.68 
 
 		 3132 aa  68.6  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  25.07 
 
 		 3474 aa  68.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1916 aa  68.2  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.53 
 
 		 1094 aa  67.8  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  32.58 
 
 		 2555 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  31.28 
 
 		 3544 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.81 
 
 		 1884 aa  67.4  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  31.28 
 
 		 2522 aa  66.6  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  37.59 
 
 		 715 aa  66.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  25.67 
 
 		 814 aa  66.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  30.33 
 
 		 2127 aa  65.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.16 
 
 		 761 aa  65.1  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  28.51 
 
 		 679 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  26.92 
 
 		 561 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  26.94 
 
 		 3089 aa  64.3  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.38 
 
 		 2476 aa  63.9  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.08 
 
 		 2272 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1682 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  27.05 
 
 		 1911 aa  62.4  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  27.78 
 
 		 669 aa  62  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  28.22 
 
 		 1120 aa  61.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  27.31 
 
 		 2036 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.39 
 
 		 2507 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  25.31 
 
 		 713 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  26.34 
 
 		 1241 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.75 
 
 		 1969 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  27.52 
 
 		 1057 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1667 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.23 
 
 		 5745 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  27.57 
 
 		 1565 aa  59.7  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  27 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  26.36 
 
 		 1300 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  27.62 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.5 
 
 		 752 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  29.95 
 
 		 873 aa  59.3  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.22 
 
 		 1882 aa  58.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  31.5 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  27.08 
 
 		 2000 aa  57.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  26.83 
 
 		 685 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  26.48 
 
 		 658 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1109 aa  57.4  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  31.62 
 
 		 1602 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.14 
 
 		 2122 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  25.62 
 
 		 575 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  39.45 
 
 		 1141 aa  56.6  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.02 
 
 		 1750 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  39.62 
 
 		 1029 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  32.88 
 
 		 1011 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  24.35 
 
 		 721 aa  56.2  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.13 
 
 		 892 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  26.47 
 
 		 1842 aa  55.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  25.56 
 
 		 1269 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 		 1867 aa  55.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  25.83 
 
 		 1268 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  31.95 
 
 		 734 aa  55.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  26.59 
 
 		 1463 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  26.27 
 
 		 978 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.06 
 
 		 1987 aa  54.7  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  26.19 
 
 		 4854 aa  54.3  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.94 
 
 		 816 aa  54.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  24.25 
 
 		 2767 aa  53.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.68 
 
 		 1620 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  24.69 
 
 		 675 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  31.78 
 
 		 999 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  30.11 
 
 		 792 aa  52.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>