85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1920 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  100 
 
 		 3834 aa  7640    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  46.26 
 
 		 2024 aa  852    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  42.58 
 
 		 2345 aa  550  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  34.46 
 
 		 4120 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  40.32 
 
 		 1933 aa  240  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  32.34 
 
 		 904 aa  189  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  32.15 
 
 		 808 aa  164  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  39.19 
 
 		 3608 aa  145  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.24 
 
 		 3619 aa  142  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.63 
 
 		 3619 aa  138  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  30.3 
 
 		 910 aa  113  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  35.45 
 
 		 1126 aa  101  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  56.38 
 
 		 3977 aa  95.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  33.79 
 
 		 2950 aa  93.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  38.3 
 
 		 1554 aa  92.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  31.9 
 
 		 818 aa  89.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  29.55 
 
 		 496 aa  85.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.36 
 
 		 2182 aa  80.5  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  29.01 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  36.23 
 
 		 4379 aa  72.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  46.07 
 
 		 1827 aa  71.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  39.18 
 
 		 7284 aa  71.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.74 
 
 		 4978 aa  70.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  50 
 
 		 1526 aa  70.9  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  33.57 
 
 		 3714 aa  69.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  25.93 
 
 		 4723 aa  68.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  35.85 
 
 		 3587 aa  67.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  35.62 
 
 		 1838 aa  67.4  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  35.85 
 
 		 3587 aa  67.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1538 aa  67  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  24.49 
 
 		 2418 aa  65.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2801  dystroglycan-type cadherin-like  38.6 
 
 		 671 aa  65.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000577586  decreased coverage  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  27.66 
 
 		 2133 aa  65.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1289 aa  64.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.16 
 
 		 16311 aa  63.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.5 
 
 		 1019 aa  62.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  31.78 
 
 		 8871 aa  61.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  28.93 
 
 		 2132 aa  61.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.88 
 
 		 4896 aa  61.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.15 
 
 		 1143 aa  60.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  39.47 
 
 		 1650 aa  60.1  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.57 
 
 		 1507 aa  60.1  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  25.83 
 
 		 2461 aa  59.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  32.35 
 
 		 637 aa  59.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  33.33 
 
 		 1315 aa  59.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  30.61 
 
 		 2802 aa  58.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  23.91 
 
 		 2367 aa  58.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  25.31 
 
 		 938 aa  58.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.39 
 
 		 1607 aa  58.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  24.2 
 
 		 9867 aa  57.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  29.41 
 
 		 2853 aa  57.4  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.62 
 
 		 737 aa  57  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 		 1876 aa  57  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  34.12 
 
 		 979 aa  57  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  27.59 
 
 		 426 aa  55.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  25.9 
 
 		 4334 aa  56.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  35.84 
 
 		 861 aa  55.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  23.91 
 
 		 2411 aa  55.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  25.88 
 
 		 1855 aa  54.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  30.36 
 
 		 3193 aa  54.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  24.07 
 
 		 940 aa  54.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  39.08 
 
 		 1557 aa  53.9  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  20.56 
 
 		 587 aa  53.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  25.16 
 
 		 3132 aa  53.5  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  33.57 
 
 		 1013 aa  53.5  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.23 
 
 		 1288 aa  51.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.21 
 
 		 3508 aa  50.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.93 
 
 		 2713 aa  50.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.86 
 
 		 3427 aa  50.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  25.18 
 
 		 922 aa  49.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  24.27 
 
 		 2454 aa  50.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  27.74 
 
 		 5899 aa  50.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.86 
 
 		 2656 aa  49.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  25.9 
 
 		 337 aa  50.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  36.15 
 
 		 2342 aa  48.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  36.15 
 
 		 2342 aa  49.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  24.7 
 
 		 3954 aa  48.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  25.66 
 
 		 3089 aa  48.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  25.13 
 
 		 1057 aa  48.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  25.42 
 
 		 2772 aa  48.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  57.14 
 
 		 741 aa  47.8  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  57.14 
 
 		 734 aa  47.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  30.4 
 
 		 296 aa  47.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  22.88 
 
 		 2402 aa  47  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1976 aa  46.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>