14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2801 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2801  dystroglycan-type cadherin-like  100 
 
 		 671 aa  1317    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000577586  decreased coverage  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  40 
 
 		 2743 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  38.6 
 
 		 3834 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  31.69 
 
 		 5020 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.94 
 
 		 14916 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  40.74 
 
 		 2024 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  36.96 
 
 		 1554 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  36.84 
 
 		 3758 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.94 
 
 		 2812 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  41.77 
 
 		 5094 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  37.8 
 
 		 2567 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  39.78 
 
 		 1206 aa  45.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  38.98 
 
 		 4120 aa  45.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  32.63 
 
 		 2318 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>