35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2021 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  54.95 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  41.57 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  43.96 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  41.33 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  36.22 
 
 		 956 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  35.78 
 
 		 783 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  34.13 
 
 		 599 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  32.28 
 
 		 604 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  29.13 
 
 		 1107 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  32.49 
 
 		 1426 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  38.06 
 
 		 772 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  45.26 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  32.45 
 
 		 773 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  27.32 
 
 		 743 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  35.77 
 
 		 611 aa  62.4  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  26.61 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  35.76 
 
 		 709 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  28.88 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2957  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  28.92 
 
 		 703 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00499  acid phosphatase  30.43 
 
 		 773 aa  52.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 504 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  31.53 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  31.45 
 
 		 573 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  34.48 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  30.4 
 
 		 3834 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  29.17 
 
 		 7919 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  30.36 
 
 		 7679 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 589 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  32.37 
 
 		 545 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 480 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  28.39 
 
 		 5899 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1538 aa  42.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>