92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1149 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
2217 aa  4299    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.27 
 
 
5613 aa  245  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  37.14 
 
 
1447 aa  226  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  44.44 
 
 
2334 aa  225  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.59 
 
 
3589 aa  224  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  34.22 
 
 
1451 aa  223  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.55 
 
 
2887 aa  222  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  44.59 
 
 
2328 aa  215  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  33.99 
 
 
1999 aa  210  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.85 
 
 
2387 aa  209  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.16 
 
 
607 aa  207  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.39 
 
 
4016 aa  203  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.53 
 
 
2054 aa  201  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.99 
 
 
1105 aa  200  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.3 
 
 
1691 aa  196  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  44.26 
 
 
1058 aa  192  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  29.65 
 
 
1910 aa  192  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.78 
 
 
1081 aa  188  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  42.49 
 
 
390 aa  187  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.45 
 
 
2744 aa  187  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  34.6 
 
 
1994 aa  187  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  34.52 
 
 
2271 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  39.92 
 
 
2716 aa  185  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  43.25 
 
 
2079 aa  184  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.61 
 
 
800 aa  181  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.99 
 
 
985 aa  181  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  42.19 
 
 
1169 aa  181  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  44.49 
 
 
1018 aa  179  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  43.92 
 
 
770 aa  177  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  38.08 
 
 
1009 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.22 
 
 
1004 aa  175  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  35.14 
 
 
1419 aa  172  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  37.81 
 
 
991 aa  172  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.35 
 
 
1137 aa  171  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  37.67 
 
 
1003 aa  171  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.18 
 
 
1148 aa  170  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  39.72 
 
 
1417 aa  170  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.82 
 
 
4855 aa  169  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.58 
 
 
956 aa  162  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.3 
 
 
4500 aa  161  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.65 
 
 
2834 aa  159  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.22 
 
 
3132 aa  159  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  34.4 
 
 
1371 aa  152  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.71 
 
 
481 aa  139  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.77 
 
 
1637 aa  130  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  32.79 
 
 
3349 aa  119  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.52 
 
 
1844 aa  114  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  30.77 
 
 
2679 aa  113  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  29.81 
 
 
3299 aa  112  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.92 
 
 
3340 aa  103  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  36.9 
 
 
1013 aa  100  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  37.93 
 
 
4135 aa  99  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  38.5 
 
 
715 aa  99  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  32.59 
 
 
4009 aa  98.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.77 
 
 
808 aa  95.5  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0775  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  37.5 
 
 
265 aa  95.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0520448  normal  0.89727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  38.86 
 
 
4170 aa  95.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.65 
 
 
759 aa  94.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  31.47 
 
 
4347 aa  92  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.47 
 
 
1741 aa  90.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  28.91 
 
 
4030 aa  90.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  29.43 
 
 
4177 aa  89.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  40.41 
 
 
4435 aa  89  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  30.9 
 
 
4184 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.76 
 
 
2637 aa  88.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  27.51 
 
 
4007 aa  88.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  30.29 
 
 
3472 aa  84.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32 
 
 
4219 aa  83.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.13 
 
 
4132 aa  82.8  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.67 
 
 
946 aa  81.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  28.87 
 
 
4049 aa  80.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  28.17 
 
 
3409 aa  79.7  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  34.74 
 
 
1526 aa  78.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.18 
 
 
1650 aa  75.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  29.63 
 
 
3332 aa  73.6  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  41.67 
 
 
4283 aa  70.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  49.3 
 
 
122 aa  68.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.94 
 
 
3299 aa  60.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.08 
 
 
3535 aa  58.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.85 
 
 
3419 aa  58.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0323  hypothetical protein  36.52 
 
 
555 aa  53.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.164337  normal  0.192178 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  35.29 
 
 
553 aa  53.5  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  35.29 
 
 
553 aa  53.5  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1759  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.17 
 
 
758 aa  50.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.03 
 
 
2296 aa  49.3  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  31.09 
 
 
804 aa  48.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3442  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.41 
 
 
952 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  29.9 
 
 
1439 aa  48.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2674  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.41 
 
 
952 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0463  hypothetical protein  26.29 
 
 
562 aa  48.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  41.18 
 
 
2927 aa  47  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2352  filamentous haemagglutinin-like protein  27.94 
 
 
820 aa  45.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>