97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0780 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
3132 aa  5920    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.08 
 
 
1105 aa  219  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  34.85 
 
 
2716 aa  218  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.41 
 
 
3589 aa  218  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  37.8 
 
 
1994 aa  213  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  37.8 
 
 
2271 aa  211  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.27 
 
 
2887 aa  212  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.69 
 
 
985 aa  208  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.99 
 
 
607 aa  205  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  42.03 
 
 
1451 aa  205  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.57 
 
 
1081 aa  204  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.1 
 
 
1004 aa  204  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.27 
 
 
2387 aa  204  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.97 
 
 
2054 aa  202  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  31.31 
 
 
1910 aa  202  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.93 
 
 
800 aa  201  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  41.67 
 
 
1447 aa  200  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.33 
 
 
1137 aa  199  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  40.89 
 
 
1003 aa  199  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  40.88 
 
 
1419 aa  199  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  38.84 
 
 
2334 aa  199  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  38.66 
 
 
1058 aa  197  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  39.31 
 
 
2328 aa  195  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.72 
 
 
5613 aa  194  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  42.24 
 
 
770 aa  192  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.41 
 
 
1148 aa  192  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  39.41 
 
 
991 aa  191  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  37.58 
 
 
1417 aa  189  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  34.53 
 
 
1999 aa  185  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.57 
 
 
481 aa  184  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.04 
 
 
4016 aa  183  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  35.84 
 
 
1009 aa  180  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.7 
 
 
4855 aa  178  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  42.91 
 
 
390 aa  174  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.01 
 
 
4500 aa  169  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  37.88 
 
 
1018 aa  168  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.63 
 
 
1691 aa  164  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  39.86 
 
 
1169 aa  164  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.41 
 
 
956 aa  162  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  37.06 
 
 
2079 aa  161  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  39.02 
 
 
1371 aa  160  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.22 
 
 
2217 aa  159  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.03 
 
 
1637 aa  159  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.96 
 
 
2834 aa  149  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.88 
 
 
1844 aa  143  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.78 
 
 
3340 aa  120  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  28.77 
 
 
2679 aa  116  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  32.5 
 
 
3349 aa  114  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30.77 
 
 
1741 aa  108  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  31.82 
 
 
3299 aa  108  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  33.74 
 
 
1013 aa  107  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  31.54 
 
 
3409 aa  91.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.79 
 
 
4132 aa  91.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  32.27 
 
 
4030 aa  91.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  31.2 
 
 
4177 aa  86.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  28.5 
 
 
4170 aa  85.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  28.93 
 
 
4135 aa  85.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  37.12 
 
 
2914 aa  84  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  30.93 
 
 
3472 aa  82.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  27.8 
 
 
4184 aa  82.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.64 
 
 
3535 aa  81.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  30.58 
 
 
4009 aa  80.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.57 
 
 
808 aa  79.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.4 
 
 
3419 aa  78.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  39.04 
 
 
985 aa  78.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  30.22 
 
 
4435 aa  77.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  31.36 
 
 
4347 aa  76.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.67 
 
 
1672 aa  76.3  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.44 
 
 
4219 aa  75.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  28.63 
 
 
4049 aa  73.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  27.6 
 
 
715 aa  73.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  27.39 
 
 
3332 aa  72.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.46 
 
 
1650 aa  71.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  45.5 
 
 
442 aa  68.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  30.48 
 
 
621 aa  67.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.41 
 
 
759 aa  67  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  28.19 
 
 
4007 aa  65.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3603  hypothetical protein  31.25 
 
 
619 aa  61.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  35.2 
 
 
1689 aa  60.1  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  43.79 
 
 
382 aa  59.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  38.27 
 
 
2851 aa  59.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  31.93 
 
 
15831 aa  56.2  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.38 
 
 
946 aa  55.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.87 
 
 
3298 aa  56.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  30.8 
 
 
918 aa  55.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0787  pseudouridine synthase  34.23 
 
 
728 aa  55.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000926536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  32.12 
 
 
8980 aa  53.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  35.71 
 
 
839 aa  53.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.26 
 
 
36805 aa  52.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.32 
 
 
3537 aa  51.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  31.62 
 
 
680 aa  51.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  26.72 
 
 
4283 aa  51.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  40.82 
 
 
344 aa  49.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  29.29 
 
 
12741 aa  49.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  45.05 
 
 
1426 aa  48.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  32.78 
 
 
403 aa  47.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 
648 aa  46.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>