161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1156 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 979 aa  1976    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30 
 
 		 913 aa  299  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.34 
 
 		 926 aa  283  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.07 
 
 		 915 aa  278  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.82 
 
 		 910 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.5 
 
 		 906 aa  254  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  30.37 
 
 		 965 aa  231  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  29.08 
 
 		 909 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  28.78 
 
 		 942 aa  220  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  28.78 
 
 		 998 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 959 aa  212  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  28.3 
 
 		 949 aa  204  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  28.18 
 
 		 970 aa  202  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  28.88 
 
 		 970 aa  201  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  28.22 
 
 		 911 aa  190  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.37 
 
 		 947 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.43 
 
 		 995 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  25.37 
 
 		 991 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  24.56 
 
 		 1028 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  23.67 
 
 		 1055 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  24.2 
 
 		 1004 aa  106  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  24.94 
 
 		 1033 aa  104  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  24.09 
 
 		 1038 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  23.93 
 
 		 1001 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1446 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  23.8 
 
 		 1001 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.86 
 
 		 983 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.32 
 
 		 710 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1325 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  25.64 
 
 		 1129 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  25.64 
 
 		 1131 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  25.64 
 
 		 1131 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  25.64 
 
 		 1131 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  23.08 
 
 		 954 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  25.84 
 
 		 1129 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  25.84 
 
 		 1131 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  26.22 
 
 		 1119 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  25.64 
 
 		 1131 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  26.09 
 
 		 1130 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.37 
 
 		 1125 aa  73.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  25.33 
 
 		 1121 aa  72.4  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 		 1333 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  25.11 
 
 		 1006 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0257  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.42 
 
 		 449 aa  70.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  26.94 
 
 		 1041 aa  68.2  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  24.01 
 
 		 974 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  26.94 
 
 		 1041 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  28.82 
 
 		 1550 aa  67  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.55 
 
 		 1782 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  24.46 
 
 		 986 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.5 
 
 		 1694 aa  63.9  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.38 
 
 		 972 aa  64.3  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.87 
 
 		 429 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.3 
 
 		 1322 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.55 
 
 		 1285 aa  63.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  25.14 
 
 		 1164 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 		 1253 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.21 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.88 
 
 		 1060 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.25 
 
 		 919 aa  62  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12480  subtilisin-like serine protease  26.99 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.998475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.56 
 
 		 1848 aa  58.9  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  24.51 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  25.28 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.54 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  25.49 
 
 		 995 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  35.48 
 
 		 1459 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2247  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.58 
 
 		 536 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  24.58 
 
 		 399 aa  56.6  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  24.39 
 
 		 2003 aa  56.6  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.27 
 
 		 1361 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.72 
 
 		 535 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.81 
 
 		 431 aa  55.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  33.64 
 
 		 1458 aa  55.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.67 
 
 		 816 aa  55.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  25.53 
 
 		 980 aa  55.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 		 1078 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  34.56 
 
 		 1066 aa  53.9  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  28.51 
 
 		 1769 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0299  hypothetical protein  27.38 
 
 		 577 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.32 
 
 		 449 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0797814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.35 
 
 		 577 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.78 
 
 		 1230 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1224  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.09 
 
 		 458 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 		 398 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3421  subtilisin DY  29.81 
 
 		 496 aa  53.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 		 445 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00404816  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  34.26 
 
 		 1333 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  26.62 
 
 		 533 aa  53.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.95 
 
 		 634 aa  52.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  26.32 
 
 		 298 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.5 
 
 		 1239 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.18 
 
 		 770 aa  52  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3748  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.03 
 
 		 531 aa  52  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2240  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.86 
 
 		 429 aa  52  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0389  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1035 aa  51.6  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  24.24 
 
 		 1078 aa  51.6  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.65 
 
 		 298 aa  51.6  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>