More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00703 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00703  serine protease  100 
 
 
911 aa  1820    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  32.33 
 
 
959 aa  289  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.17 
 
 
913 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.08 
 
 
915 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.54 
 
 
906 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.07 
 
 
926 aa  247  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  31.8 
 
 
942 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.05 
 
 
910 aa  239  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  30.55 
 
 
965 aa  230  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  30.74 
 
 
970 aa  227  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  29.51 
 
 
909 aa  224  6e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  30.42 
 
 
949 aa  224  8e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  30.55 
 
 
998 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  30.27 
 
 
947 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  30.31 
 
 
970 aa  217  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.22 
 
 
979 aa  208  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 
1033 aa  147  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.04 
 
 
1004 aa  141  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  37.7 
 
 
954 aa  138  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  34.98 
 
 
974 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  31.4 
 
 
1446 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  26.03 
 
 
1006 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.93 
 
 
1028 aa  127  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  27.29 
 
 
1055 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  28.26 
 
 
1038 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.31 
 
 
710 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.46 
 
 
1125 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  31.92 
 
 
995 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  31.43 
 
 
991 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  31.5 
 
 
1001 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  30.97 
 
 
983 aa  101  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.95 
 
 
1001 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.98 
 
 
1134 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  35.08 
 
 
1156 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  33.44 
 
 
1239 aa  91.3  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  28.33 
 
 
1154 aa  90.9  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2643  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.48 
 
 
462 aa  90.1  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.98 
 
 
634 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  34.63 
 
 
1179 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.68 
 
 
452 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.45 
 
 
1011 aa  81.6  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 
500 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  27.89 
 
 
298 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2302  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 
959 aa  80.1  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.676415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.57 
 
 
754 aa  80.1  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  33.33 
 
 
683 aa  79.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.21 
 
 
298 aa  79  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.88 
 
 
634 aa  79  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.8 
 
 
349 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.8 
 
 
718 aa  77  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.94 
 
 
449 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0797814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.77 
 
 
770 aa  75.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  28.72 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.49 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1224  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.08 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.26 
 
 
577 aa  75.1  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.46 
 
 
398 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  40.41 
 
 
1177 aa  73.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.71 
 
 
576 aa  73.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  28.39 
 
 
641 aa  73.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0791  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.94 
 
 
835 aa  73.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.9 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  27.08 
 
 
1130 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.31 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.948372  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30 
 
 
1361 aa  70.5  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  26.01 
 
 
1129 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  26.01 
 
 
1131 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  28.39 
 
 
533 aa  70.1  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  26.01 
 
 
1129 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  26.01 
 
 
1131 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  26.01 
 
 
1131 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  26.01 
 
 
1131 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  26.01 
 
 
1131 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 
597 aa  69.3  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.6 
 
 
1106 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.71 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.72 
 
 
520 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.43 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.29 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.09 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8383  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.9 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57734  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.13 
 
 
688 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.53 
 
 
1060 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  33.93 
 
 
995 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.33 
 
 
392 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0605  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.34 
 
 
431 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  27.55 
 
 
576 aa  67.4  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  40 
 
 
986 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  28.71 
 
 
644 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8518  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 
400 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  normal  0.0186801 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  28.62 
 
 
1315 aa  67  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.87 
 
 
1324 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 
370 aa  66.6  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 
627 aa  65.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 
689 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.65 
 
 
348 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0938  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.71 
 
 
412 aa  65.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.31 
 
 
463 aa  65.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.230581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.65 
 
 
661 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>