More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0234 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  100 
 
 
998 aa  1995    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  93.19 
 
 
970 aa  1636    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  95.89 
 
 
970 aa  1794    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  93.36 
 
 
949 aa  1628    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  72.53 
 
 
909 aa  1321    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.46 
 
 
947 aa  484  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.94 
 
 
915 aa  294  7e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.12 
 
 
926 aa  290  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.35 
 
 
910 aa  284  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.88 
 
 
913 aa  275  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.87 
 
 
906 aa  269  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  30.13 
 
 
959 aa  248  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.81 
 
 
979 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  30.31 
 
 
911 aa  201  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.65 
 
 
954 aa  187  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  28.04 
 
 
1055 aa  186  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  27.13 
 
 
1028 aa  177  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26.83 
 
 
1038 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  33.82 
 
 
974 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.29 
 
 
1004 aa  175  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.59 
 
 
1033 aa  166  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  27.73 
 
 
991 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.17 
 
 
1125 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  24.93 
 
 
1006 aa  152  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  27.67 
 
 
1001 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.55 
 
 
1001 aa  137  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.67 
 
 
995 aa  128  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  24.59 
 
 
1154 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.06 
 
 
710 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.4 
 
 
1134 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  30.43 
 
 
1325 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.84 
 
 
1156 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  24.87 
 
 
1179 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  30.36 
 
 
983 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.47 
 
 
1446 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  28.49 
 
 
1175 aa  92.4  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  38.89 
 
 
657 aa  89  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.52 
 
 
754 aa  88.2  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  38.73 
 
 
652 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  37.56 
 
 
652 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.36 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.97 
 
 
634 aa  85.5  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.62 
 
 
661 aa  84.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  35.06 
 
 
683 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  27.82 
 
 
485 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  27.64 
 
 
1121 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.63 
 
 
718 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  27.04 
 
 
1041 aa  82.4  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
653 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
653 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  27.04 
 
 
1041 aa  82.4  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  37.02 
 
 
653 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.88 
 
 
1489 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.03 
 
 
635 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  26.8 
 
 
995 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  50 
 
 
268 aa  79  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.29 
 
 
816 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.63 
 
 
1177 aa  78.2  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.76 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.2 
 
 
634 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  25.47 
 
 
986 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.7 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.98 
 
 
577 aa  74.7  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.84 
 
 
500 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.75 
 
 
431 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.29 
 
 
1782 aa  72.8  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  27.05 
 
 
1129 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  27.05 
 
 
1131 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  27.05 
 
 
1131 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  27.05 
 
 
1131 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  27.05 
 
 
1131 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.85 
 
 
1532 aa  72  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.3 
 
 
429 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  27.05 
 
 
1131 aa  72  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.78 
 
 
919 aa  71.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  34.33 
 
 
1281 aa  72  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.74 
 
 
627 aa  71.6  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.23 
 
 
1011 aa  71.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  26.83 
 
 
1129 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.44 
 
 
1361 aa  70.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.11 
 
 
398 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2302  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.74 
 
 
959 aa  69.3  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.676415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0471  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.82 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 
1164 aa  68.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0755  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.61 
 
 
679 aa  68.9  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.312676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  29.84 
 
 
3506 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  24.52 
 
 
1119 aa  68.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 
627 aa  68.6  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.68 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  51.81 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  24.38 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  24.67 
 
 
1550 aa  68.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.92 
 
 
429 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.84 
 
 
597 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.83 
 
 
1029 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  45.33 
 
 
259 aa  67  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.62 
 
 
349 aa  65.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.57 
 
 
710 aa  66.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  35.83 
 
 
533 aa  66.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.25 
 
 
605 aa  65.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>