More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2954 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  100 
 
 
947 aa  1868    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  49.59 
 
 
942 aa  766    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  42.09 
 
 
965 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  43.09 
 
 
970 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  41.54 
 
 
909 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  43.09 
 
 
949 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  42.56 
 
 
970 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.08 
 
 
926 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.76 
 
 
915 aa  283  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.16 
 
 
913 aa  282  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.87 
 
 
910 aa  279  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.85 
 
 
906 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 
959 aa  240  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  31.02 
 
 
911 aa  210  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27 
 
 
1004 aa  193  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.59 
 
 
979 aa  193  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  25.56 
 
 
1033 aa  191  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.74 
 
 
1125 aa  180  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  29.9 
 
 
954 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  25.67 
 
 
1028 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  34.12 
 
 
974 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  27.9 
 
 
1006 aa  156  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  24.83 
 
 
1055 aa  148  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  24.29 
 
 
1038 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.12 
 
 
710 aa  141  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.9 
 
 
983 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.54 
 
 
995 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.95 
 
 
1154 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.72 
 
 
1001 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  25.91 
 
 
991 aa  125  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  30.58 
 
 
1325 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  27 
 
 
1156 aa  121  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  24.6 
 
 
1001 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.65 
 
 
1134 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.69 
 
 
1179 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  28.89 
 
 
1446 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  27.27 
 
 
1175 aa  95.1  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.55 
 
 
634 aa  94.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.79 
 
 
577 aa  94  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.04 
 
 
754 aa  92.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  29.03 
 
 
485 aa  92.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.71 
 
 
1177 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  25.34 
 
 
986 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  25.81 
 
 
995 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  33.09 
 
 
683 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0471  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.77 
 
 
433 aa  86.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2643  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.11 
 
 
462 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.9 
 
 
634 aa  87  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 
626 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
718 aa  85.1  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.68 
 
 
626 aa  85.1  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.81 
 
 
627 aa  84.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 
487 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.64 
 
 
627 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  26.76 
 
 
1121 aa  82.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.22 
 
 
689 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5144  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.73 
 
 
464 aa  80.5  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.8 
 
 
688 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.76 
 
 
770 aa  80.1  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  26.6 
 
 
1078 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  28.26 
 
 
576 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.55 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.59 
 
 
349 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.21 
 
 
500 aa  79  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1791  serine protease  26.53 
 
 
1066 aa  79  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0261515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  30.4 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2302  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.71 
 
 
959 aa  77.8  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.676415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  31.78 
 
 
657 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.98 
 
 
612 aa  76.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.62 
 
 
1011 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  26.24 
 
 
1041 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  31.9 
 
 
653 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  27.82 
 
 
1164 aa  76.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  26.24 
 
 
1041 aa  75.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.75 
 
 
587 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  29.23 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  39.34 
 
 
653 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  39.34 
 
 
653 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  32.19 
 
 
652 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 
627 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.45 
 
 
587 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27 
 
 
452 aa  73.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.29 
 
 
444 aa  74.3  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
398 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  29.03 
 
 
1315 aa  73.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 
397 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27 
 
 
1532 aa  72.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  32.19 
 
 
652 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
682 aa  72.8  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8381  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  32.27 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  40.48 
 
 
641 aa  72  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.1 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.43 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.62 
 
 
1361 aa  71.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2980  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 
411 aa  71.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.398884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.11 
 
 
1205 aa  70.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.57 
 
 
661 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  25.81 
 
 
1782 aa  70.5  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
1060 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>