27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3385 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  87.34 
 
 		 312 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  87.34 
 
 		 312 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  84.49 
 
 		 283 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  82.7 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  71.05 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  78.12 
 
 		 281 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  53.03 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  53.03 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  53.91 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  56.12 
 
 		 264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  41.35 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  38.52 
 
 		 224 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  39.26 
 
 		 232 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  41.67 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  39.24 
 
 		 589 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  41.94 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  35.09 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  33.07 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  32.71 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  32.71 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  31.86 
 
 		 198 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  33.54 
 
 		 2914 aa  54.3  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  32.61 
 
 		 2179 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  27.68 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>