29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0168 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 		 264 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  55.2 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  46.43 
 
 		 312 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  46.43 
 
 		 312 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  45.83 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  50 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  55.93 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  47.02 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  46.25 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  47.73 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  45 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  53.27 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  38.22 
 
 		 184 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  39.69 
 
 		 232 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  40.69 
 
 		 589 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  36.36 
 
 		 224 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  38.4 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  35.21 
 
 		 165 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  37.31 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  42.71 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  32.97 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  34.17 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  37.84 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  37.04 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  37.25 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  33.64 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.08 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  36.78 
 
 		 167 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>