100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  57.19 
 
 		 308 aa  295  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  56.25 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  70.51 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  69.23 
 
 		 192 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  67.57 
 
 		 466 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  57.73 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  60.26 
 
 		 372 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  58.54 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  59.49 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  59.49 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  60 
 
 		 485 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  54.21 
 
 		 431 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  60.26 
 
 		 547 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  54.21 
 
 		 433 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  54.21 
 
 		 433 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  56.67 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  61.64 
 
 		 407 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  61.84 
 
 		 375 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  61.25 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  61.84 
 
 		 375 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  61.84 
 
 		 375 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  65.48 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  66.2 
 
 		 444 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  54.43 
 
 		 416 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  60.53 
 
 		 375 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  60.56 
 
 		 222 aa  99  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  52.63 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  59.21 
 
 		 375 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  50.49 
 
 		 106 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  50.98 
 
 		 224 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  57.89 
 
 		 428 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  56.1 
 
 		 461 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  52.38 
 
 		 397 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  55.56 
 
 		 682 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  47.71 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  47.71 
 
 		 152 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  47.71 
 
 		 152 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  54.22 
 
 		 205 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  56.58 
 
 		 495 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  53.42 
 
 		 400 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  41.5 
 
 		 170 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  52.22 
 
 		 1409 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  41.18 
 
 		 170 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  51.58 
 
 		 118 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  51.58 
 
 		 118 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 111 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  51.58 
 
 		 118 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  40.62 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  43.12 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  47.57 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  47.57 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  47.57 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  45.54 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  45.54 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  53.42 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  46.94 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  53.16 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  47.66 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  48.19 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  46.46 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  47.42 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  37.01 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  37.5 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  47.44 
 
 		 439 aa  65.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  56.36 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  43.59 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  36.43 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  41.11 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  39.53 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  38.46 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  40.51 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.48 
 
 		 553 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  37.97 
 
 		 436 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  45.95 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  39.24 
 
 		 416 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  39.74 
 
 		 385 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  39.24 
 
 		 427 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  30.33 
 
 		 418 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  31.03 
 
 		 420 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  31.03 
 
 		 420 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  31.03 
 
 		 420 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  31.03 
 
 		 420 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  31.03 
 
 		 420 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.71 
 
 		 684 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  31.03 
 
 		 426 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  27.63 
 
 		 564 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  31.3 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  27.86 
 
 		 564 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  27.86 
 
 		 564 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  30.17 
 
 		 432 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  30.17 
 
 		 413 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  28.83 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  39.74 
 
 		 366 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  27.14 
 
 		 564 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  27.93 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  32.2 
 
 		 578 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  32.17 
 
 		 577 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  27.52 
 
 		 426 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>