79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4479 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  100 
 
 		 433 aa  782    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 433 aa  782    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  83.22 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  82.64 
 
 		 466 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  70.83 
 
 		 407 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  52.34 
 
 		 211 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  62.2 
 
 		 222 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  61.9 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  75 
 
 		 228 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  64.1 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  70.51 
 
 		 192 aa  119  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  58.44 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  53.39 
 
 		 224 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  55.08 
 
 		 228 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  70.42 
 
 		 256 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  59.74 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  62.16 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  62.16 
 
 		 547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  62.16 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  60 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  68.49 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  60 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  58.67 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  50 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  64 
 
 		 682 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  61.64 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  66.2 
 
 		 274 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 118 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 118 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  65.33 
 
 		 107 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  53.47 
 
 		 152 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  53.47 
 
 		 152 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  60 
 
 		 118 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  64.47 
 
 		 106 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  60.26 
 
 		 205 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  64.71 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  58.33 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  58.33 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  59.26 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  53.85 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  62.5 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  60.81 
 
 		 171 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  58.33 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  62.03 
 
 		 171 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  62.03 
 
 		 171 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  52.25 
 
 		 212 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  62.03 
 
 		 171 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  61.64 
 
 		 111 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  60.27 
 
 		 188 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  52.63 
 
 		 473 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  54.84 
 
 		 1409 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  66.22 
 
 		 176 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  62.16 
 
 		 153 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  55.13 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  60.81 
 
 		 170 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  58.33 
 
 		 170 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  43.48 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  49.41 
 
 		 154 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3011  hypothetical protein  57.63 
 
 		 175 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.596013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3289  hypothetical protein  56.14 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238624  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  44.57 
 
 		 227 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  45.33 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  42.67 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2722  hypothetical protein  52.63 
 
 		 170 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2752  hypothetical protein  52.63 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104243  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2766  hypothetical protein  52.63 
 
 		 170 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  44.87 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  38.26 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  41.94 
 
 		 225 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  46.38 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  43.75 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  43.42 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  42.11 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  48.78 
 
 		 317 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  41.25 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>