99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0905 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  66.06 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  44.04 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  42.78 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  38.1 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  40 
 
 		 205 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  41 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  67.05 
 
 		 461 aa  121  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  44.51 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  62.35 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  43.62 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  58.65 
 
 		 106 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  49.61 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  62.35 
 
 		 387 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  59.52 
 
 		 547 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  59.52 
 
 		 348 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  59.52 
 
 		 348 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  52.73 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  58.62 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  58.62 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  52.63 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  52.73 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  58.62 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  52.73 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  62.34 
 
 		 372 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  51.56 
 
 		 170 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  51.16 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  57.84 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  56.32 
 
 		 375 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  57.84 
 
 		 152 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  42.66 
 
 		 485 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  55.17 
 
 		 375 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  57.84 
 
 		 152 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  69.44 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  54.81 
 
 		 118 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  54.81 
 
 		 118 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  54.81 
 
 		 118 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  53.45 
 
 		 350 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  57.73 
 
 		 107 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  57.65 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  57.5 
 
 		 473 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  50 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  55.34 
 
 		 153 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  60.98 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  66.67 
 
 		 407 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  51.4 
 
 		 111 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  65.06 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  62.5 
 
 		 171 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  46.21 
 
 		 431 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  46.21 
 
 		 433 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  46.21 
 
 		 433 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  61.33 
 
 		 466 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  60 
 
 		 444 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  60 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  65.28 
 
 		 428 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 682 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  55.26 
 
 		 479 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  55.26 
 
 		 439 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  44.36 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  56.34 
 
 		 495 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  59.72 
 
 		 1409 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  37.4 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  50.67 
 
 		 499 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  46.74 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  41.9 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  48.1 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  40.74 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  46.84 
 
 		 427 aa  75.1  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  51.47 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  44.44 
 
 		 416 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  41.77 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  48 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  41.77 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  41.1 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  43.84 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  41.1 
 
 		 366 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  38.1 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  40.58 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  45.21 
 
 		 375 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  40.79 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  46.3 
 
 		 97 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  36.99 
 
 		 409 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  43.75 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  37.68 
 
 		 399 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  40.68 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  41.27 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 123 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 168 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1323  Peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.6395e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 		 334 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  36.49 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 307 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  40.85 
 
 		 243 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  35.42 
 
 		 380 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.18 
 
 		 155 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.06 
 
 		 233 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>