119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2795 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  40.71 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  58.33 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  55.1 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  52.83 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  52.83 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  55.1 
 
 		 456 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 1051 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  49.15 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  51.92 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.93 
 
 		 155 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  50.94 
 
 		 158 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  48.98 
 
 		 372 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  48.98 
 
 		 372 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 500 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  34.78 
 
 		 146 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.02 
 
 		 954 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  34.72 
 
 		 389 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  50.98 
 
 		 531 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0415  peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00826728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  34.93 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 474 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  54.17 
 
 		 312 aa  48.5  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0018  LysM domain-containing protein  46.55 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000125361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  53.06 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0431  LysM domain-containing protein  52 
 
 		 374 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00107019  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  50.94 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.78 
 
 		 334 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  50.94 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  50 
 
 		 568 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 590 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  30.32 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  52.94 
 
 		 509 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  51.92 
 
 		 546 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  44.9 
 
 		 299 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  29.17 
 
 		 318 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 153 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  37.31 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  47.17 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  47.17 
 
 		 163 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 162 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  49.06 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  40.82 
 
 		 292 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 162 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  50 
 
 		 341 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  34.07 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  47.17 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  47.17 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  47.17 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  33.91 
 
 		 146 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  44.83 
 
 		 1086 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  47.17 
 
 		 156 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  45.28 
 
 		 166 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  45.45 
 
 		 663 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 154 aa  45.1  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  32.54 
 
 		 145 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  29.03 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  47.17 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  29.03 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 572 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03299  hypothetical protein  41.67 
 
 		 338 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  48.08 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.9 
 
 		 75 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  29.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  29.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  29.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  29.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  29.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  46.94 
 
 		 638 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  40.82 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1315  peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  42.86 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  32.5 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  29.68 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  45.28 
 
 		 167 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  48.08 
 
 		 560 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 680 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  44.9 
 
 		 419 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  45.83 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  28.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  31.03 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 97 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2610  LysM domain-containing protein  34.33 
 
 		 512 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.417796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 156 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 339 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 156 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 156 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  47.17 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  43.75 
 
 		 303 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 149 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 		 149 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>