89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4557 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 399 aa  789    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  47.75 
 
 		 428 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  37.99 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  35.83 
 
 		 473 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  39.26 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  37.13 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  35.37 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  37.74 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  37.91 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  35.87 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  36.68 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  35.05 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  35.05 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  35.05 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  35.46 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  35.2 
 
 		 547 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  33.16 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  35.57 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  34.28 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  34.28 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  32.97 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  35.23 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  34.25 
 
 		 436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  30.81 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  29.33 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  33.91 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  32.44 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  31.65 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  38.39 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  37.56 
 
 		 266 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  31.32 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  32.39 
 
 		 451 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  29.45 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  25.94 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  55.41 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  35.52 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  24.82 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  52.17 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  29.14 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  33.33 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  46.25 
 
 		 118 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  46.25 
 
 		 118 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  46.25 
 
 		 118 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  28.47 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  29.24 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  28.26 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  47.83 
 
 		 266 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  24.34 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  46.67 
 
 		 111 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  44 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  47.37 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  20.32 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  35.45 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  44.12 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  21.01 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  44 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  44 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  44.74 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  44 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  20.32 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  43.42 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  46.91 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  42.86 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  44.44 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  49.21 
 
 		 126 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  32.06 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  41.33 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  40 
 
 		 170 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  39.51 
 
 		 181 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  39.51 
 
 		 152 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  39.51 
 
 		 152 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  38.67 
 
 		 153 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  43.24 
 
 		 106 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  44 
 
 		 107 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  43.94 
 
 		 247 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  42.03 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  45.45 
 
 		 239 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  26.55 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  32.11 
 
 		 275 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  26.55 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  38.03 
 
 		 154 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  30.25 
 
 		 352 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  42.47 
 
 		 227 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  30.39 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  34.94 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  23.33 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  37.68 
 
 		 231 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  22.33 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>