100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2728 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  100 
 
 
416 aa  806    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  58.31 
 
 
427 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  43.05 
 
 
499 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  40.44 
 
 
439 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  48.83 
 
 
436 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  46.45 
 
 
479 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  50.5 
 
 
451 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  42.94 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  38.35 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  38.29 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  37.43 
 
 
375 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  33.66 
 
 
387 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  34.61 
 
 
375 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  37.87 
 
 
266 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  28.85 
 
 
473 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  33.33 
 
 
375 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  31.73 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  30.86 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  33.06 
 
 
375 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  33.06 
 
 
375 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  33.06 
 
 
375 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  32.63 
 
 
547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  32.8 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  31.34 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  31.34 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  30.83 
 
 
362 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  33.91 
 
 
399 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  29.89 
 
 
400 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  30.07 
 
 
485 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  31.32 
 
 
428 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  55.84 
 
 
223 aa  96.3  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  33.56 
 
 
412 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  28.25 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  51.25 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  28.28 
 
 
479 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  26.74 
 
 
460 aa  80.1  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  34.48 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  31.02 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  32.55 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  53.95 
 
 
225 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  50.72 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  49.33 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  29.32 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  40.54 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  46.25 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  45.57 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  46.48 
 
 
212 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  44.16 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  47.44 
 
 
228 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  46.99 
 
 
107 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  29.03 
 
 
295 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  43.75 
 
 
222 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  41.67 
 
 
205 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  46.27 
 
 
224 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  44.58 
 
 
126 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  47.83 
 
 
224 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  45.07 
 
 
205 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  23.65 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  36.08 
 
 
347 aa  59.7  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  53.23 
 
 
128 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  45.45 
 
 
154 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  45.21 
 
 
111 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  45.21 
 
 
106 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  44.44 
 
 
188 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 
118 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  44.44 
 
 
118 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  45.83 
 
 
171 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  45.83 
 
 
171 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  45.83 
 
 
171 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 
153 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 
118 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  44.87 
 
 
211 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  45.21 
 
 
171 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  24.56 
 
 
401 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  43.04 
 
 
308 aa  57  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  31.88 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  43.06 
 
 
170 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  43.06 
 
 
170 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  41.33 
 
 
176 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  40.79 
 
 
256 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  41.25 
 
 
466 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  37.62 
 
 
682 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  47.14 
 
 
1409 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  39.24 
 
 
274 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  43.48 
 
 
181 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  39.47 
 
 
328 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  40 
 
 
444 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  43.48 
 
 
152 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  43.48 
 
 
152 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  38.55 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  37.93 
 
 
473 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  38.55 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  41.03 
 
 
228 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  38.55 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  40.51 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  28.26 
 
 
343 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  38.46 
 
 
192 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  32.84 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  25.19 
 
 
340 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>