80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4170 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  45.13 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  68.83 
 
 		 416 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  64.63 
 
 		 485 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  46.33 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  51.45 
 
 		 433 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  51.45 
 
 		 433 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  51.45 
 
 		 431 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  54.24 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  40.89 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  72.5 
 
 		 211 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  69.74 
 
 		 466 aa  124  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  52.17 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  50.72 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  55.81 
 
 		 256 aa  121  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  67.11 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  67.11 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  67.11 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  53.85 
 
 		 407 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  68.42 
 
 		 444 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  40.7 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  65.33 
 
 		 348 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  64.04 
 
 		 308 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  65.33 
 
 		 547 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  65.33 
 
 		 348 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  43.32 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  63.16 
 
 		 375 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  53.45 
 
 		 328 aa  114  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  63.16 
 
 		 375 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  59.55 
 
 		 682 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  63.16 
 
 		 362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  56.67 
 
 		 461 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  59.55 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  42.11 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  60.26 
 
 		 473 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  39.47 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  48.06 
 
 		 176 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  60.29 
 
 		 397 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  61.76 
 
 		 495 aa  101  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  54.55 
 
 		 106 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  41.95 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  60.29 
 
 		 400 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  63.24 
 
 		 428 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 170 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  62.67 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  53.77 
 
 		 171 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  53.77 
 
 		 171 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  53.77 
 
 		 171 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  46.15 
 
 		 170 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  52.43 
 
 		 107 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  52.81 
 
 		 1409 aa  92  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  57.69 
 
 		 387 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  59.72 
 
 		 181 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  59.72 
 
 		 152 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  59.72 
 
 		 152 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  45.38 
 
 		 266 aa  88.2  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  51.92 
 
 		 118 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  39.16 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  51.92 
 
 		 118 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  51.92 
 
 		 118 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  51.49 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  53.41 
 
 		 111 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  49 
 
 		 154 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  58.33 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  39.33 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  53.25 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  51.95 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  47.3 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  47.44 
 
 		 499 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  48.1 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 416 aa  65.5  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  43.42 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  41.03 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  34.74 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  38.16 
 
 		 436 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  40.79 
 
 		 385 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  31.86 
 
 		 266 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  40.79 
 
 		 366 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  29.61 
 
 		 382 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  39.77 
 
 		 375 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>