117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3857 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  781    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  41.99 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  39.63 
 
 		 473 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  39.13 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  37.82 
 
 		 375 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  38.34 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  35.09 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  36.24 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  35.47 
 
 		 479 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  36.48 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  36.48 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  36.48 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  35.93 
 
 		 547 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  35.65 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  33.88 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  35.84 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  35.84 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  33.78 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  35.5 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  33.98 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  37.08 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  35.09 
 
 		 409 aa  166  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  30.41 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  33.76 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  30.72 
 
 		 495 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  30.11 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  32.99 
 
 		 436 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  32.49 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  33.14 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  32.84 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  31.51 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  32.56 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  35.34 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  52.38 
 
 		 212 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  61.9 
 
 		 231 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  29.7 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  66.67 
 
 		 205 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  58.33 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  27.34 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  33.83 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  59.3 
 
 		 176 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  32.65 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  65.22 
 
 		 118 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  65.22 
 
 		 118 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  61.97 
 
 		 111 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  65.22 
 
 		 118 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  52.69 
 
 		 223 aa  97.8  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  51.61 
 
 		 181 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  62.32 
 
 		 171 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  63.77 
 
 		 205 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  66.67 
 
 		 106 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  51.06 
 
 		 152 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  51.06 
 
 		 152 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  54.65 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  65.22 
 
 		 107 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  58.75 
 
 		 222 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  65.71 
 
 		 188 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  55.29 
 
 		 211 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  27.8 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  57.89 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  57.69 
 
 		 228 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  57.89 
 
 		 444 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  57.89 
 
 		 171 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  57.89 
 
 		 171 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  57.89 
 
 		 171 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  57.97 
 
 		 224 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  57.89 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  44.35 
 
 		 170 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  53.66 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  53.66 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  53.66 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  56.34 
 
 		 170 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  56.58 
 
 		 192 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  26.2 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  56.63 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  56.58 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  54.17 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  24.65 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  48.31 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  56.41 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  55 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  25.87 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  49.37 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  50 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  47.5 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  48.72 
 
 		 682 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  46.25 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  24.82 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  49.33 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  47.95 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  53.62 
 
 		 1409 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  23.89 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  46.38 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  27.14 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  20.85 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  21.18 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  22.78 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  22.02 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  35.78 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  20.92 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>