79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22420 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  100 
 
 
328 aa  655    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  35.17 
 
 
350 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  49.12 
 
 
222 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  67.53 
 
 
211 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  56.88 
 
 
433 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  56.88 
 
 
431 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  56.88 
 
 
433 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  65.38 
 
 
466 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  59.26 
 
 
407 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  39.11 
 
 
224 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  68 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  72.22 
 
 
228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  54.62 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  60 
 
 
192 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  60.98 
 
 
228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  64.47 
 
 
461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  75 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  61.97 
 
 
348 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  61.97 
 
 
348 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  61.97 
 
 
547 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  52.34 
 
 
375 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  52.34 
 
 
375 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  52.34 
 
 
375 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  63.01 
 
 
375 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  55.56 
 
 
308 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  61.64 
 
 
375 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  65.28 
 
 
205 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  56.67 
 
 
274 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  53.85 
 
 
372 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  53.15 
 
 
106 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  57.89 
 
 
473 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  52.21 
 
 
118 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  52.21 
 
 
118 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  52.78 
 
 
107 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  49.06 
 
 
362 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  52.21 
 
 
118 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  50 
 
 
485 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  53 
 
 
111 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  45.76 
 
 
181 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  49.52 
 
 
205 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  48.51 
 
 
231 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  62.16 
 
 
495 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  48.54 
 
 
152 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  48.54 
 
 
152 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  52.34 
 
 
212 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  60.76 
 
 
171 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  52.04 
 
 
176 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  49.06 
 
 
171 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  49.06 
 
 
171 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  49.06 
 
 
171 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  55.84 
 
 
682 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  59.72 
 
 
188 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  60.29 
 
 
428 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  52.63 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  58.33 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  60.56 
 
 
1409 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  57.89 
 
 
397 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  46.36 
 
 
153 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  44.95 
 
 
170 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  54.17 
 
 
170 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  41.06 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  50.6 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  30.29 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  43.75 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  39.39 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  44 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  35.58 
 
 
266 aa  62.8  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  43.66 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  43.42 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  41.33 
 
 
479 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  38.36 
 
 
239 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  42.11 
 
 
436 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  39.47 
 
 
499 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  42.31 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  37.33 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  39.47 
 
 
416 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  46.15 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  38.03 
 
 
224 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  36.84 
 
 
427 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>