82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2620 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 
170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  91.76 
 
 
170 aa  320  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  52.38 
 
 
171 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  52.38 
 
 
171 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  52.38 
 
 
171 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  65.49 
 
 
111 aa  144  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  48.72 
 
 
153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  50.3 
 
 
181 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  51.61 
 
 
152 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  51.61 
 
 
152 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  64.29 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  64.29 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  64.29 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  63.06 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  61.47 
 
 
106 aa  130  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  58.1 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  76 
 
 
188 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  58.62 
 
 
176 aa  124  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  65.96 
 
 
205 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  70 
 
 
171 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  69.14 
 
 
205 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  55.1 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  59.57 
 
 
231 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  51.4 
 
 
212 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  51.46 
 
 
350 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  56.67 
 
 
192 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  53.26 
 
 
362 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  45.05 
 
 
375 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  58.9 
 
 
407 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  56.76 
 
 
375 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  56.76 
 
 
375 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  56.76 
 
 
375 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  56.76 
 
 
375 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  55.79 
 
 
444 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  61.64 
 
 
466 aa  89  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  57.32 
 
 
211 aa  88.2  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  53.33 
 
 
461 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  51.61 
 
 
222 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  54.67 
 
 
495 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  56.34 
 
 
387 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  54.17 
 
 
328 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  50 
 
 
433 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  45.45 
 
 
223 aa  85.5  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 
433 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 
431 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  56 
 
 
228 aa  85.1  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  44.23 
 
 
308 aa  84.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  52.56 
 
 
547 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  49.37 
 
 
473 aa  84.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  52.86 
 
 
428 aa  84.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  52.56 
 
 
348 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  52.56 
 
 
348 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  58.82 
 
 
256 aa  84  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  57.33 
 
 
416 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  54.05 
 
 
372 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  51.35 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  52.7 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  52.11 
 
 
274 aa  78.2  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  52.78 
 
 
682 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  42.71 
 
 
1409 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  45.24 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  48.61 
 
 
400 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  47.89 
 
 
479 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  47.89 
 
 
439 aa  67.4  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  37.74 
 
 
227 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  43.06 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  36.11 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  44.16 
 
 
385 aa  65.1  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  44.44 
 
 
499 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  45.33 
 
 
366 aa  64.3  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  41.89 
 
 
436 aa  63.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  39.74 
 
 
225 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  45.59 
 
 
224 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  40.54 
 
 
239 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  45.45 
 
 
325 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  38.16 
 
 
317 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  43.06 
 
 
427 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  43.9 
 
 
375 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  40 
 
 
399 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  43.06 
 
 
416 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  29.73 
 
 
266 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  37.5 
 
 
409 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>