102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  100 
 
 		 308 aa  621  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  57.64 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  65.55 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  47.02 
 
 		 228 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  73.24 
 
 		 192 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  65.38 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  58.42 
 
 		 228 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  60.49 
 
 		 362 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  63.75 
 
 		 485 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  51.82 
 
 		 433 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  51.82 
 
 		 433 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  51.82 
 
 		 431 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  58.59 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  60.76 
 
 		 416 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  60 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  60.76 
 
 		 547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  34.38 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  41.57 
 
 		 222 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  52.54 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  64.47 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  64.47 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  64.47 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  65.38 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  62.03 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  69.01 
 
 		 444 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  47.27 
 
 		 407 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  61.84 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  60.53 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  57.32 
 
 		 461 aa  99.8  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  61.76 
 
 		 428 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  47.66 
 
 		 106 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  51.69 
 
 		 682 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  58.57 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  54.88 
 
 		 397 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  54.12 
 
 		 205 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  47.32 
 
 		 181 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  56.58 
 
 		 495 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  44.6 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  47.57 
 
 		 224 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  60.87 
 
 		 1409 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  48.65 
 
 		 111 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 107 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  49.52 
 
 		 152 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  49.52 
 
 		 152 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  51.22 
 
 		 473 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  53.64 
 
 		 118 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  53.64 
 
 		 118 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  53.64 
 
 		 118 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  47.32 
 
 		 212 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  40 
 
 		 170 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  55 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  44.86 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  46.15 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  47.66 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  51.85 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  47.47 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  47.47 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  47.47 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  52.7 
 
 		 188 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  54.55 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  50 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  41.13 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  51.28 
 
 		 439 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  58.46 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  35.2 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  44.16 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  61.4 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  60 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  46.84 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  60 
 
 		 926 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  44.74 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  40.2 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  42.7 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  48.65 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  58.33 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  65.31 
 
 		 1261 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  41.67 
 
 		 416 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  45.57 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  44.26 
 
 		 928 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  36.73 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  55.56 
 
 		 423 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  42.67 
 
 		 385 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  38.16 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  59.26 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  51.56 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0525  hypothetical protein  60.47 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  59.46 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  65.31 
 
 		 501 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  46.3 
 
 		 857 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 2539 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  54.39 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  27.66 
 
 		 772 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  41.82 
 
 		 1281 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  40 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  51.16 
 
 		 613 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  39.53 
 
 		 375 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>