92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0821 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  100 
 
 
222 aa  431  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  62.99 
 
 
433 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  62.99 
 
 
431 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  62.99 
 
 
433 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  61.76 
 
 
407 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  62.32 
 
 
444 aa  158  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  63.64 
 
 
211 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  60.9 
 
 
466 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  58.27 
 
 
328 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  63.27 
 
 
350 aa  131  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  74.36 
 
 
416 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  56.91 
 
 
224 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  63.53 
 
 
228 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  64.22 
 
 
256 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  66.23 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  61.54 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  43.85 
 
 
485 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  72.22 
 
 
228 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  57.69 
 
 
107 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  59.46 
 
 
547 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  59.46 
 
 
348 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  59.46 
 
 
348 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  60.26 
 
 
375 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  62.03 
 
 
461 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  60.26 
 
 
375 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  60.26 
 
 
375 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  48.31 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  62.34 
 
 
473 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  55.88 
 
 
106 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  54.17 
 
 
682 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  51.14 
 
 
372 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  55.56 
 
 
205 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  57.69 
 
 
375 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  47.29 
 
 
176 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  42.69 
 
 
223 aa  104  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  46.72 
 
 
181 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  56.41 
 
 
375 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  63.01 
 
 
308 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  56.96 
 
 
362 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  63.01 
 
 
495 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  51.52 
 
 
152 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  51.52 
 
 
152 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  65.28 
 
 
1409 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  52.29 
 
 
231 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  56.32 
 
 
118 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  57.65 
 
 
171 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  56.32 
 
 
118 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  56.32 
 
 
118 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  57.65 
 
 
171 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  57.65 
 
 
171 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  60.56 
 
 
274 aa  98.6  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  58.43 
 
 
387 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  60.87 
 
 
428 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  49.04 
 
 
153 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 
400 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  60.27 
 
 
188 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  58.54 
 
 
111 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  57.33 
 
 
397 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  58.9 
 
 
171 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  48.21 
 
 
170 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  44.7 
 
 
170 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  45.87 
 
 
154 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  47.96 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  45.26 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  49.3 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  38.81 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  47.37 
 
 
439 aa  65.9  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  38.46 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  38.02 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  43.42 
 
 
479 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  43.75 
 
 
416 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  44.16 
 
 
436 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  42.86 
 
 
499 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  46.75 
 
 
385 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  36.26 
 
 
317 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  58.93 
 
 
270 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  58.93 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  34.67 
 
 
266 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  37.66 
 
 
427 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  38.36 
 
 
224 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  51.43 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  42.11 
 
 
366 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  68.18 
 
 
275 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  59.18 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  41.98 
 
 
375 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0581  cell surface protein  46.88 
 
 
941 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2244  type IV pilus assembly PilZ  42.11 
 
 
1416 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.35167  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  36.44 
 
 
128 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>