145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4365 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  67.26 
 
 		 227 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  39.35 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  40.31 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  36.61 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  67.14 
 
 		 325 aa  108  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  38.25 
 
 		 317 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  58.11 
 
 		 479 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  34.42 
 
 		 350 aa  89  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  57.53 
 
 		 439 aa  89.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  46.96 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  41.07 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  53.95 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  43.75 
 
 		 107 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  53.95 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  43.69 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  40.95 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  45.24 
 
 		 461 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  46.75 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  42.72 
 
 		 118 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  42.72 
 
 		 118 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  42.72 
 
 		 118 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  54.17 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  49.32 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  46.25 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  50 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  44.68 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  45.24 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  45.57 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  42.86 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  42.68 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  45.07 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  62.96 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  41.94 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  41.75 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  43.37 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  43.37 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  43.37 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  39.09 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.36 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  39.29 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  39.29 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  39.29 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  43.84 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  36.61 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  41.86 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  52.05 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.98 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  41.03 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  41.23 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  41.86 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  41.86 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  41.86 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  36.79 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  35.24 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  41.46 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 256 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  38.79 
 
 		 433 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  38.79 
 
 		 433 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  38.79 
 
 		 431 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  40.26 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  38.1 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  39.74 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  44.05 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  37.5 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  41.46 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  41.46 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  41.46 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  40.26 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  43.84 
 
 		 409 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  38.67 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  38.38 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  37.5 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  42.86 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  43.06 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  36.9 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  37.18 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  38.96 
 
 		 444 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  44.44 
 
 		 2277 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  43.48 
 
 		 1409 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  39.47 
 
 		 495 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  36.05 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  58.33 
 
 		 428 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  44 
 
 		 1089 aa  52  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  49.02 
 
 		 423 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.03 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  39.53 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.54 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 667 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.61 
 
 		 433 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  51.02 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  37.5 
 
 		 400 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.61 
 
 		 665 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  35.44 
 
 		 682 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.16 
 
 		 356 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  37.5 
 
 		 397 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>