56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6585 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  72.87 
 
 		 126 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  52.24 
 
 		 439 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  53.12 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  50.67 
 
 		 266 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  43.21 
 
 		 366 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 479 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  49.23 
 
 		 436 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  53.23 
 
 		 416 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  44.44 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  40.21 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  35.83 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  50.82 
 
 		 499 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  36.75 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  36.45 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  38 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  35.4 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  35.4 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  35.4 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  46.88 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  52.94 
 
 		 409 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  49.21 
 
 		 375 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  46.27 
 
 		 427 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  39.39 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  41.03 
 
 		 317 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  45.76 
 
 		 266 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  36.36 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  41 
 
 		 350 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  40.26 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  40.26 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  40.26 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  35.35 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  33.94 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  40.17 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  42.19 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  34.34 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  32.11 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  35.79 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  40.62 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  41.54 
 
 		 400 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  35.29 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  37.5 
 
 		 205 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 329 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  40.58 
 
 		 271 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  48.65 
 
 		 282 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  33.33 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2147  protein of unknown function/lipoprotein, putative  40.32 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.211278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  48.65 
 
 		 258 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  48.72 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  33.72 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  33.72 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  33.72 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  40 
 
 		 397 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  31.19 
 
 		 276 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>