84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3962 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  224  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  86.61 
 
 		 118 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  86.61 
 
 		 118 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  86.61 
 
 		 118 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  85.59 
 
 		 171 aa  175  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  72.07 
 
 		 107 aa  161  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  65.49 
 
 		 170 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  63.64 
 
 		 170 aa  139  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  66.04 
 
 		 106 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  70 
 
 		 205 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  59.82 
 
 		 205 aa  134  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  67.33 
 
 		 224 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  81.33 
 
 		 188 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  58.18 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  58.18 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  58.18 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  59.62 
 
 		 181 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  59.62 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  59.62 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  55.45 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  55.05 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  57.78 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  61.86 
 
 		 212 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  56.6 
 
 		 350 aa  107  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  63.89 
 
 		 231 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  61.97 
 
 		 387 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  49.49 
 
 		 223 aa  97.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  63.01 
 
 		 444 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  65.75 
 
 		 407 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  60.27 
 
 		 466 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  60.81 
 
 		 362 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  59.74 
 
 		 433 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  59.74 
 
 		 433 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  59.74 
 
 		 431 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  60.27 
 
 		 222 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  55.7 
 
 		 461 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  51.46 
 
 		 328 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  63.89 
 
 		 211 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  53.16 
 
 		 473 aa  92  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  55.41 
 
 		 485 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  44.26 
 
 		 375 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  58.11 
 
 		 228 aa  91.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  56.76 
 
 		 375 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  56.76 
 
 		 375 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  56.76 
 
 		 375 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  58.67 
 
 		 495 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  55.41 
 
 		 375 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  58.9 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  55.13 
 
 		 547 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  55.13 
 
 		 348 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  55.13 
 
 		 348 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  55.41 
 
 		 416 aa  87.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  57.75 
 
 		 479 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  57.33 
 
 		 228 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  45.37 
 
 		 308 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  40.5 
 
 		 372 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  56.76 
 
 		 682 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  47.06 
 
 		 256 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  55.71 
 
 		 428 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  56.34 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 385 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  51.39 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  48.19 
 
 		 397 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  49.35 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  47.89 
 
 		 439 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  51.35 
 
 		 1409 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 436 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  51.39 
 
 		 499 aa  72  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  44.44 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  48.61 
 
 		 427 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  45.59 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  42.47 
 
 		 317 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  45.95 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  40.54 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  46.67 
 
 		 399 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  38.89 
 
 		 247 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  46.77 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  39.09 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  41.03 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  43.06 
 
 		 416 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  39.71 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  38.71 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  39.47 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>