84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3637 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  100 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  86.61 
 
 
111 aa  190  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  86.61 
 
 
171 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  75.93 
 
 
107 aa  167  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  62.83 
 
 
205 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  68.93 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  64.29 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  60 
 
 
224 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  62.16 
 
 
170 aa  137  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  71.91 
 
 
205 aa  135  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  85.14 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  58.88 
 
 
171 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  58.88 
 
 
171 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  58.88 
 
 
171 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  55.75 
 
 
181 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  61 
 
 
152 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  61 
 
 
152 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  50.93 
 
 
153 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  65.56 
 
 
212 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  55.24 
 
 
176 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  63.95 
 
 
350 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  48.25 
 
 
154 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  62.82 
 
 
231 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  60.71 
 
 
433 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  60.71 
 
 
433 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  60.71 
 
 
431 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  64.86 
 
 
444 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  64.38 
 
 
466 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  60.98 
 
 
211 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  52.08 
 
 
223 aa  97.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  65.22 
 
 
387 aa  97.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  66.67 
 
 
407 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  62.5 
 
 
328 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  60.27 
 
 
222 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  60.81 
 
 
362 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 
375 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  60 
 
 
375 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 
375 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  56.96 
 
 
461 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  60.81 
 
 
375 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  60.81 
 
 
228 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  58.67 
 
 
375 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  61.64 
 
 
192 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  50 
 
 
473 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  54.32 
 
 
416 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  59.46 
 
 
495 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 
547 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  46.46 
 
 
485 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  57.33 
 
 
348 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 
348 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  57.5 
 
 
228 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  57.75 
 
 
479 aa  85.5  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  58.57 
 
 
428 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  49.04 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  60.29 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  51.35 
 
 
372 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  57.75 
 
 
274 aa  78.2  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  48 
 
 
227 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  52 
 
 
682 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  51.32 
 
 
385 aa  77.4  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  47.89 
 
 
439 aa  76.6  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  45.33 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  52.78 
 
 
1409 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  51.47 
 
 
400 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  51.47 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  51.39 
 
 
499 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  46.99 
 
 
366 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  48.61 
 
 
436 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  50.68 
 
 
427 aa  69.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  45.59 
 
 
266 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  46.25 
 
 
399 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  46.05 
 
 
266 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  46.05 
 
 
317 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  48.39 
 
 
325 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  42.03 
 
 
247 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  40.58 
 
 
239 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  40.7 
 
 
409 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  38.32 
 
 
375 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  44.44 
 
 
416 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  39.71 
 
 
224 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  38.89 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  35.56 
 
 
126 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>