85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  50.97 
 
 		 224 aa  188  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  45.18 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  43.62 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  70 
 
 		 111 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  71.91 
 
 		 118 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  71.91 
 
 		 118 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  71.91 
 
 		 118 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  41.97 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  74.68 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  69.32 
 
 		 107 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  64.44 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  64.44 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  64.44 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  38.81 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  40.31 
 
 		 231 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  69.41 
 
 		 106 aa  124  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  62.5 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  63.22 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  62.5 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  62.5 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  69.14 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  67.9 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  74.67 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  39.36 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  62.96 
 
 		 350 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  69.44 
 
 		 176 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  49.23 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  58.82 
 
 		 461 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  66.25 
 
 		 407 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  41.25 
 
 		 328 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  66.67 
 
 		 387 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  65.28 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  63.89 
 
 		 466 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  40.74 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  54.22 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  54.22 
 
 		 348 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  54.22 
 
 		 547 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  56.96 
 
 		 473 aa  98.6  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  52.38 
 
 		 154 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  62.5 
 
 		 444 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  62.5 
 
 		 431 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  62.5 
 
 		 433 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  62.5 
 
 		 433 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  56.63 
 
 		 362 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  63.24 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  58.11 
 
 		 416 aa  92  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  57.75 
 
 		 375 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  56.94 
 
 		 375 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  56.94 
 
 		 375 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  55.56 
 
 		 375 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  56.94 
 
 		 375 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  52.7 
 
 		 485 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  46.39 
 
 		 308 aa  88.2  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  52.7 
 
 		 372 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  56 
 
 		 495 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  56.34 
 
 		 274 aa  85.5  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  54.93 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  57.14 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  51.95 
 
 		 682 aa  81.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  49.37 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  55.17 
 
 		 1409 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  51.95 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  50.6 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  54.17 
 
 		 439 aa  79  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  46.75 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  37.5 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  52.78 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  30.68 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  47.22 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  47.44 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  46.25 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  43.68 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  45.57 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  40.86 
 
 		 409 aa  65.5  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  35.71 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  44 
 
 		 399 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  41.67 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  37.84 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  44.12 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  46.67 
 
 		 432 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  52.73 
 
 		 560 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  52.17 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>