103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3233 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 485 aa  971    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  46.5 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  40.51 
 
 		 547 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  44.67 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  44.67 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  42.82 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  42.82 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  42.82 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  40.88 
 
 		 375 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  41.44 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  40.58 
 
 		 362 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  35.8 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  34.4 
 
 		 473 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  34.45 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  34.53 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  32.29 
 
 		 397 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  32.37 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  32.2 
 
 		 495 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  65.88 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  33.7 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  30.33 
 
 		 439 aa  133  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  67.09 
 
 		 228 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  32.15 
 
 		 366 aa  123  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  32.76 
 
 		 399 aa  123  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  30 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  62.67 
 
 		 444 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  32.46 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  59.26 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  60.71 
 
 		 256 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  58.67 
 
 		 466 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  58.44 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  58.44 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  58.44 
 
 		 431 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  63.75 
 
 		 308 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  58.97 
 
 		 222 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  59.74 
 
 		 211 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  57.33 
 
 		 407 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  57.5 
 
 		 350 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  34.47 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  56.32 
 
 		 231 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  28.92 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  60 
 
 		 274 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  58.67 
 
 		 192 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  49.51 
 
 		 682 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  54.67 
 
 		 328 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  52.17 
 
 		 205 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  46.9 
 
 		 223 aa  94.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  43.7 
 
 		 224 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  59.15 
 
 		 181 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  59.15 
 
 		 152 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  59.15 
 
 		 152 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  60.27 
 
 		 212 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  55.41 
 
 		 111 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  55.41 
 
 		 188 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  53.25 
 
 		 171 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  55.41 
 
 		 118 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  55.41 
 
 		 118 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  55.41 
 
 		 118 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  52.7 
 
 		 205 aa  87.4  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  54.67 
 
 		 106 aa  86.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  29.95 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  51.35 
 
 		 170 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  26.15 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  52 
 
 		 170 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 153 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  55.13 
 
 		 107 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  28.49 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  25.56 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  54.17 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  54.17 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  54.17 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  27.68 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  51.28 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  23.51 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  51.28 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  48.15 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  52.05 
 
 		 154 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  49.3 
 
 		 1409 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  51.28 
 
 		 239 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  46.15 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  26.61 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  23.36 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  41.03 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  25.2 
 
 		 295 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  37.97 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  40.85 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  34.21 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  27.53 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  30.47 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  39.76 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  25.82 
 
 		 338 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  20.37 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  26.39 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  24.62 
 
 		 340 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  24.1 
 
 		 340 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  28.97 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  28.97 
 
 		 337 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  33.87 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  26.96 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  29.36 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>