100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1712 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  100 
 
 		 348 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  97.7 
 
 		 547 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 348 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  64.16 
 
 		 375 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  65.7 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  65.7 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  65.7 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  62.97 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  62.21 
 
 		 375 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  44.25 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  44.67 
 
 		 485 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  39.09 
 
 		 461 aa  228  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  38.57 
 
 		 473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  35.23 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  35.84 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  33.15 
 
 		 397 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  32.65 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  35.17 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  31.31 
 
 		 495 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  31.41 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  33.43 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  34.44 
 
 		 479 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  32.14 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  34.39 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  76.06 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  65.33 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  55.42 
 
 		 416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  35.27 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  67.57 
 
 		 192 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  66.67 
 
 		 228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  59.52 
 
 		 231 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  59.46 
 
 		 222 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  60.76 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  60.53 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  59.49 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  61.97 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  58.75 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  62.16 
 
 		 211 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  62.16 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  62.16 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  62.16 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  62.16 
 
 		 444 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  63.01 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  64.38 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  31.98 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  62.03 
 
 		 106 aa  99.8  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  59.21 
 
 		 223 aa  99  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  54.88 
 
 		 205 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  52.27 
 
 		 682 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  27.01 
 
 		 439 aa  95.9  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  64.79 
 
 		 181 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  63.89 
 
 		 152 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  63.89 
 
 		 152 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  59.72 
 
 		 224 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  31.39 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  55.13 
 
 		 171 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  58.67 
 
 		 188 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 		 118 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  27.69 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  57.33 
 
 		 118 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  55.13 
 
 		 111 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 		 118 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  51.76 
 
 		 205 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  26.19 
 
 		 499 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  52.33 
 
 		 170 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  58.33 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  50.6 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  52.56 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  54.67 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  29.81 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  59.46 
 
 		 153 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  53.85 
 
 		 171 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  53.85 
 
 		 171 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  53.85 
 
 		 171 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  52.78 
 
 		 1409 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  32.56 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  46.67 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  29.45 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  25.93 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  25.19 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  47.83 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  28.38 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  25.29 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  24.91 
 
 		 460 aa  62.8  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  49.32 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  43.48 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  41.46 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  33.33 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  40.91 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  35.94 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  20.07 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  19.71 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  22.35 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  30.21 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  22 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  21.85 
 
 		 479 aa  46.6  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  19.51 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  30.43 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  25.93 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>