108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4558 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 428 aa  830    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  49.31 
 
 		 495 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  48.12 
 
 		 399 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  39.45 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  37.25 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  37.25 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  37.25 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  37.6 
 
 		 375 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  37.6 
 
 		 375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  36.53 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  34.1 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  37.02 
 
 		 547 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  35.9 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  35.9 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  35.8 
 
 		 485 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  37.25 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  36.17 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  34.52 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  34.43 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  36.1 
 
 		 366 aa  163  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  35.07 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  33.73 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  32.81 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  35.91 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  34.93 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  35.09 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  30.03 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  34.03 
 
 		 439 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  35.71 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  65.91 
 
 		 256 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  32.04 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  29.8 
 
 		 412 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  29.38 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  68.12 
 
 		 192 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  66.18 
 
 		 228 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  57.65 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  64.71 
 
 		 211 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  64.71 
 
 		 466 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  64.71 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  64.71 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  64.71 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  64.71 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  27.54 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  63.24 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  61.76 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  60.87 
 
 		 222 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  57.89 
 
 		 274 aa  94  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  37.44 
 
 		 499 aa  93.6  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  60.29 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  65.28 
 
 		 231 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  52.94 
 
 		 224 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  30.03 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  60.29 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  50.54 
 
 		 181 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  52.27 
 
 		 1409 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  56.16 
 
 		 205 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  59.42 
 
 		 106 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  57.14 
 
 		 188 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  34.19 
 
 		 391 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  59.72 
 
 		 118 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  59.72 
 
 		 118 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  59.72 
 
 		 118 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  50.54 
 
 		 152 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  50.54 
 
 		 152 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  52.86 
 
 		 170 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  53.42 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  58.57 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  45.26 
 
 		 682 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  56.34 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  55.71 
 
 		 111 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  57.14 
 
 		 107 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  54.29 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  54.29 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  54.29 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  57.97 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  61.76 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  51.32 
 
 		 154 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  30.58 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  26.11 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  48.81 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  29.2 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  36.94 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  25.62 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  46.58 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  45.59 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  47.69 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  22.78 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  45.07 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  22.88 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  25.98 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  25.22 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  63.89 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  41.54 
 
 		 239 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  24.11 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  35.71 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  27.62 
 
 		 337 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  27.62 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  33.01 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  34.31 
 
 		 338 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>