87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2237 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  100 
 
 
516 aa  962    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  39.41 
 
 
374 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  31.17 
 
 
788 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  32.47 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  32.02 
 
 
777 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  32.54 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  32.54 
 
 
298 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  32.54 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.71 
 
 
246 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.71 
 
 
245 aa  57.4  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  29.86 
 
 
270 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  29.86 
 
 
270 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  29.86 
 
 
270 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  34.97 
 
 
243 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.21 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  40.17 
 
 
190 aa  53.5  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  30 
 
 
267 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4758  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.21 
 
 
241 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.52 
 
 
275 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.435379  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.6 
 
 
259 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  32.14 
 
 
544 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.93 
 
 
259 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.06 
 
 
259 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  27.21 
 
 
243 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 
322 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  32.17 
 
 
250 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.03 
 
 
244 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.31 
 
 
259 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  28.21 
 
 
248 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.45 
 
 
259 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.31 
 
 
259 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.31 
 
 
259 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.31 
 
 
259 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.31 
 
 
259 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50.94 
 
 
232 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  24.69 
 
 
259 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.76 
 
 
432 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.3 
 
 
263 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  25.48 
 
 
852 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  31.18 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  19.7 
 
 
486 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.62 
 
 
243 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0010  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  37.35 
 
 
140 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584311  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  26.53 
 
 
236 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.62 
 
 
239 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  26.47 
 
 
182 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  30.53 
 
 
263 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.38 
 
 
407 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  23.81 
 
 
322 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  24.11 
 
 
322 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.26 
 
 
324 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.88 
 
 
243 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  45.16 
 
 
368 aa  47.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  25.77 
 
 
262 aa  46.6  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.62 
 
 
579 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.28 
 
 
279 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  25.85 
 
 
210 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.83 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.84 
 
 
248 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30.41 
 
 
241 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.79 
 
 
246 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2490  hypothetical protein  37.08 
 
 
533 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  26.47 
 
 
237 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.09 
 
 
246 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.07 
 
 
264 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.65 
 
 
246 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.65 
 
 
246 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.65 
 
 
246 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.68 
 
 
202 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.65 
 
 
246 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.09 
 
 
246 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40.98 
 
 
404 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.61 
 
 
392 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2914  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.29 
 
 
263 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  0.295776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1418  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.93 
 
 
195 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  34.68 
 
 
187 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1899  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.85 
 
 
289 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.29 
 
 
259 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  25 
 
 
237 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.84 
 
 
246 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1862  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.33 
 
 
281 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.018097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  44.44 
 
 
294 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.75 
 
 
449 aa  43.9  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.16 
 
 
246 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.59 
 
 
415 aa  43.5  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.03 
 
 
246 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.03 
 
 
246 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>