93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1254 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3140  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1254  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1371  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3502  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  76.5 
 
 
224 aa  351  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1168  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  68.81 
 
 
224 aa  322  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3163  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.97 
 
 
224 aa  314  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000280398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2977  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  67.28 
 
 
224 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1079  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.67 
 
 
226 aa  301  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.234165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0579  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  50.89 
 
 
238 aa  227  9e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2444  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  47.47 
 
 
223 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.54345  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2376  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  47 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002796  D,D-carboxypeptidase-related protein  44.89 
 
 
232 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2193  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  45.79 
 
 
233 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1735  VanY family protein  45.45 
 
 
224 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03184  hypothetical protein  43.56 
 
 
232 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02545  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  42.47 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.457217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3368  putative D,D-carboxypeptidase-related protein  43.87 
 
 
219 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0527224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2187  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.89 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222762  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1861  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.72 
 
 
250 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1764  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  50.29 
 
 
236 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1429  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.07 
 
 
232 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3180  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  38.07 
 
 
240 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1856  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  41.33 
 
 
270 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1813  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  46.41 
 
 
238 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.877549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2419  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.78 
 
 
225 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  decreased coverage  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1911  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40.82 
 
 
262 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.494098  hitchhiker  0.0000706495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2122  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40.82 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.737189  hitchhiker  0.000240208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2472  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  41.09 
 
 
252 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1646  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  42.05 
 
 
212 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.806668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2355  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.39 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0293083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2368  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.86 
 
 
237 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2471  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.86 
 
 
237 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  0.0767721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1991  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.86 
 
 
237 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  hitchhiker  0.0000000547334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1990  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.22 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2124  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.41 
 
 
238 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09648  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.22 
 
 
243 aa  98.2  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.538817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.19 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.97 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.69 
 
 
259 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.05 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.57 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.22 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.77 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.77 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.77 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.77 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.77 
 
 
259 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.77 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.95 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.47 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  29.87 
 
 
187 aa  55.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.87 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1102  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.97 
 
 
269 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.68 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  32.45 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.21 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.21 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.21 
 
 
239 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.56 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.28 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2308  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.37 
 
 
173 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000166242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2349  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.19 
 
 
246 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.19 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1557  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.11 
 
 
246 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.19 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2526  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.28 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.82 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.19 
 
 
246 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.19 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.19 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.82 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  24.36 
 
 
396 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.82 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.68 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.82 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.39 
 
 
579 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.56 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  28.4 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16800  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  37.72 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.690587  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17500  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.37 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.050833  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  29.11 
 
 
404 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04455  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  29.33 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  26.19 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.8 
 
 
391 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  25.3 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2250  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.93 
 
 
303 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0294681  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  26.38 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  27.61 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0292  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  23.64 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.9 
 
 
241 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>