80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3502 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3502  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1254  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  76.5 
 
 		 225 aa  351  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3140  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  76.5 
 
 		 225 aa  351  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1371  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  76.5 
 
 		 225 aa  351  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1168  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.51 
 
 		 224 aa  315  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3163  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.06 
 
 		 224 aa  314  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000280398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1079  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.07 
 
 		 226 aa  305  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.234165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2977  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.97 
 
 		 224 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0579  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  53.88 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2444  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  47.47 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.54345  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2376  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  46.19 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2193  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  44.84 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03184  hypothetical protein  45.54 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002796  D,D-carboxypeptidase-related protein  44.69 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1735  VanY family protein  45 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02545  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.89 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.457217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3368  putative D,D-carboxypeptidase-related protein  42.01 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0527224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2187  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.51 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222762  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3180  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  40.83 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1764  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  41.04 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1861  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.6 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1429  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.32 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2419  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.73 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  decreased coverage  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1813  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  52.35 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.877549  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1856  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40 
 
 		 270 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2472  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  45.61 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2122  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  39.5 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.737189  hitchhiker  0.000240208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1911  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  38.65 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.494098  hitchhiker  0.0000706495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1646  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  41.84 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.806668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1990  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.76 
 
 		 192 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2355  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.63 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0293083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2368  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.11 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2124  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.62 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2471  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.11 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  0.0767721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1991  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.63 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  hitchhiker  0.0000000547334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09648  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.49 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.538817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.78 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.49 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.21 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.52 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.49 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.49 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.49 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.65 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.49 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.49 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.49 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1557  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.48 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.93 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  27.33 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.58 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.77 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  27.11 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.58 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.58 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.3 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.3 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.3 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.3 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.3 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1065  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  29.79 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.57 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.67 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.28 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1102  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.45 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  24.12 
 
 		 396 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.42 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.03 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.42 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.67 
 
 		 246 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.85 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2526  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.42 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2349  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.42 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  27.37 
 
 		 241 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2308  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  24.86 
 
 		 173 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000166242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0292  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  22.09 
 
 		 257 aa  42  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.45 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.42 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>