More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1104 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  100 
 
 		 444 aa  868    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  35.5 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  35.87 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  46.03 
 
 		 271 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  47.37 
 
 		 379 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  50.5 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  46.03 
 
 		 278 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  28.74 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  32.61 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  44.3 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  31.7 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  48.04 
 
 		 271 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  46.08 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  38.71 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  39.66 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  28.46 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  31.12 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  50 
 
 		 316 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  47.69 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.94 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  40.8 
 
 		 265 aa  99  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.78 
 
 		 238 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  41.78 
 
 		 283 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  48.09 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  46.51 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  49.61 
 
 		 309 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  46.51 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  46.51 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  32.43 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  45.53 
 
 		 582 aa  97.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.06 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  50.96 
 
 		 529 aa  97.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  46.51 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  45.74 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  30.71 
 
 		 300 aa  96.7  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  41.13 
 
 		 229 aa  96.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  29.48 
 
 		 727 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  47.06 
 
 		 303 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  46.62 
 
 		 523 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  29.26 
 
 		 727 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  43.08 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  47.29 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  47.29 
 
 		 238 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  46.67 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  34.29 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  42.86 
 
 		 313 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  42.15 
 
 		 299 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40.68 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  45.39 
 
 		 468 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  47.29 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  44.88 
 
 		 751 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  47.29 
 
 		 238 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  47.29 
 
 		 512 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.83 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  47.47 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  47.29 
 
 		 471 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  49.49 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  47.47 
 
 		 456 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  43.26 
 
 		 669 aa  93.6  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  40.69 
 
 		 754 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  38.66 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  41.98 
 
 		 541 aa  93.2  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  41.67 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  46.46 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  48.48 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.28 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  38.99 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.63 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  41.98 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  52.53 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  47.29 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  47.29 
 
 		 509 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  48.51 
 
 		 411 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  43.7 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  40.8 
 
 		 237 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.8 
 
 		 303 aa  91.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  41.27 
 
 		 317 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  41.6 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  47 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  26.56 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  43.86 
 
 		 312 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  42.54 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  50.53 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  41.32 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  41.32 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  47.47 
 
 		 455 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  49.22 
 
 		 448 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  48.45 
 
 		 340 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  48.42 
 
 		 387 aa  90.5  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  44.88 
 
 		 320 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.47 
 
 		 301 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  44.53 
 
 		 474 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  46.77 
 
 		 266 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  44.44 
 
 		 440 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  35.76 
 
 		 373 aa  89.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  43.65 
 
 		 198 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  44.44 
 
 		 440 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  48.45 
 
 		 454 aa  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.46 
 
 		 455 aa  89.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  47 
 
 		 491 aa  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>