More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7995 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  100 
 
 
536 aa  1082    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  54.47 
 
 
311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  44.68 
 
 
266 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  35.66 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  42.38 
 
 
236 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.03 
 
 
751 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  34.85 
 
 
237 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  47.2 
 
 
452 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  48.54 
 
 
419 aa  102  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  46.46 
 
 
824 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  46.67 
 
 
195 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  45.67 
 
 
727 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  45.67 
 
 
727 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  45.67 
 
 
590 aa  98.6  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  43.57 
 
 
270 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  46.46 
 
 
582 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  42.65 
 
 
352 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  35.96 
 
 
231 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  35.27 
 
 
348 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  45.19 
 
 
198 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  44.09 
 
 
358 aa  93.6  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  33.17 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  41.43 
 
 
283 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  39.35 
 
 
334 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  42.45 
 
 
438 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  44.44 
 
 
198 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  33.17 
 
 
360 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  34.15 
 
 
351 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  42 
 
 
491 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  33.17 
 
 
360 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  40.58 
 
 
320 aa  91.3  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  45.16 
 
 
269 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  50 
 
 
419 aa  90.5  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  40 
 
 
455 aa  90.1  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  40.29 
 
 
511 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  46.36 
 
 
349 aa  89.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  42.61 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  42.61 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  48.67 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  48.67 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  40.98 
 
 
406 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  41.8 
 
 
458 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  41.32 
 
 
437 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  48.67 
 
 
431 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  40 
 
 
453 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  41.74 
 
 
184 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  43 
 
 
324 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  39.86 
 
 
446 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  49.56 
 
 
423 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  47.79 
 
 
431 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  47.79 
 
 
433 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  47.79 
 
 
433 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  41.98 
 
 
443 aa  87.8  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  47.79 
 
 
433 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  47.79 
 
 
433 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  45.54 
 
 
443 aa  87.8  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  46.9 
 
 
434 aa  87.4  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  43.41 
 
 
754 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.25 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  37.16 
 
 
339 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  35.86 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  36.81 
 
 
339 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.61 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  49.48 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  36.49 
 
 
340 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  40.88 
 
 
333 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  38.46 
 
 
274 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  43.14 
 
 
223 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  35.08 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  41.35 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  45.08 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  37.75 
 
 
288 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.82 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  38.84 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  41.07 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.29 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  39.23 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.23 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  42.48 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.8 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  36.24 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.48 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  41.07 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  47.17 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  48.11 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  38.57 
 
 
251 aa  84  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  48.24 
 
 
241 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  29.93 
 
 
295 aa  84  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  48.24 
 
 
247 aa  84  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  46.15 
 
 
308 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  49.06 
 
 
418 aa  84  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  47.46 
 
 
669 aa  84  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  46.24 
 
 
325 aa  84  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  41.07 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  40.77 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  47.19 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  44.63 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  44.12 
 
 
274 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  35.06 
 
 
224 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>