More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000457 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  100 
 
 		 325 aa  662    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  52.76 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  36.12 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  40.17 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  38.96 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  37.55 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  37.61 
 
 		 419 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  38.43 
 
 		 418 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  37.18 
 
 		 439 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  37.12 
 
 		 423 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  36.96 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  35.9 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.41 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  35.16 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  34.23 
 
 		 550 aa  142  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  37.12 
 
 		 428 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  34.48 
 
 		 431 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  34.48 
 
 		 431 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  34.48 
 
 		 431 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  34.93 
 
 		 431 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  34.53 
 
 		 440 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  34.98 
 
 		 436 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  35.39 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  34.93 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  34.93 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  34.93 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  34.93 
 
 		 433 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  35.51 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  35.51 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  35.51 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  35.51 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  35.51 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  33.92 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  33.92 
 
 		 410 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  33.92 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  34.58 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  34.58 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  34.58 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  34.58 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  34.58 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  34.58 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  34.58 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  34.58 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  34.58 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  36.56 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  34.22 
 
 		 441 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  34.22 
 
 		 440 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  34.58 
 
 		 439 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  35.08 
 
 		 482 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  31.72 
 
 		 470 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  33.48 
 
 		 446 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  32.59 
 
 		 486 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  31.7 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  40.88 
 
 		 507 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  33.33 
 
 		 475 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  31.88 
 
 		 462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  30.38 
 
 		 491 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  48.94 
 
 		 569 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  30.77 
 
 		 466 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.53 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  32.02 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  33.19 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  30.77 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  31.86 
 
 		 475 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  30.38 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  29.55 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  30 
 
 		 482 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  32.62 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  29.17 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  29.17 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  31.09 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  31.11 
 
 		 491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  29.07 
 
 		 468 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  43.75 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  31.14 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  31.02 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  36.94 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  32.17 
 
 		 435 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  29.62 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  31.49 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  30.87 
 
 		 498 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  30.57 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  30.57 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.86 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  30.9 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  42.22 
 
 		 446 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  31.08 
 
 		 460 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  38.15 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0266  peptidase M23B  30.84 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  36.97 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  39.57 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  29.48 
 
 		 513 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  40.43 
 
 		 490 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  39.74 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3418  peptidase M23B  30.84 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  31.28 
 
 		 665 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  27.92 
 
 		 533 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  35.67 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>