More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3816 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  100 
 
 
283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  67.71 
 
 
270 aa  344  8e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  45.45 
 
 
231 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  40.82 
 
 
269 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  50.76 
 
 
320 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  48.48 
 
 
251 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.87 
 
 
452 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  37.88 
 
 
406 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  43.17 
 
 
236 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.83 
 
 
326 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  45.45 
 
 
458 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  49.61 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  49.61 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  49.61 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  48.09 
 
 
332 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  45.04 
 
 
340 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  45.74 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  49.62 
 
 
351 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  45.77 
 
 
383 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  47.29 
 
 
339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  47.52 
 
 
399 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  51.24 
 
 
824 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  42.96 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.81 
 
 
399 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0048  TraG  43.38 
 
 
375 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000012382  normal  0.663313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  51.35 
 
 
468 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  55.1 
 
 
482 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  35.92 
 
 
402 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  47.17 
 
 
354 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  46.51 
 
 
340 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  42.34 
 
 
237 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  44.36 
 
 
266 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  49.57 
 
 
348 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  45.74 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  47.33 
 
 
311 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  45.74 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  46.15 
 
 
339 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  47.24 
 
 
582 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  51.35 
 
 
314 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  49.62 
 
 
442 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  46.88 
 
 
284 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  44.62 
 
 
431 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.45 
 
 
235 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  53 
 
 
754 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  52 
 
 
727 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  52 
 
 
727 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  55.1 
 
 
448 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  49.54 
 
 
414 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  45.87 
 
 
337 aa  99.8  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  44.27 
 
 
224 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  44.53 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  51.52 
 
 
751 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  42.03 
 
 
419 aa  99.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  51.46 
 
 
590 aa  99  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.44 
 
 
387 aa  99.4  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  42.62 
 
 
347 aa  99  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  43.7 
 
 
300 aa  99  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  44.2 
 
 
346 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  46.46 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  38.76 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  46.28 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  49.5 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  43.09 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  43.65 
 
 
423 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  44.22 
 
 
649 aa  96.3  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.52 
 
 
430 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.97 
 
 
238 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  38.15 
 
 
330 aa  95.9  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  43.48 
 
 
230 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  41.43 
 
 
536 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  44.64 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  49.12 
 
 
195 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  44.12 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  42.55 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  52.38 
 
 
445 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  47.24 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  47.79 
 
 
569 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  34.85 
 
 
391 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.65 
 
 
392 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.96 
 
 
198 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  52.29 
 
 
411 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  36.23 
 
 
1019 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  45.65 
 
 
238 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  49.02 
 
 
324 aa  93.2  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  42.98 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  44.8 
 
 
482 aa  93.6  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  46.09 
 
 
198 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  52.87 
 
 
507 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  38.55 
 
 
229 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  38.35 
 
 
357 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  33.88 
 
 
404 aa  92.8  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  41.61 
 
 
484 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  42.97 
 
 
352 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  36 
 
 
377 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  49.53 
 
 
305 aa  92.4  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  40.4 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  43.65 
 
 
453 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  50 
 
 
340 aa  92.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.91 
 
 
392 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  47.11 
 
 
379 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>