More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2227 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  100 
 
 
172 aa  341  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  57.31 
 
 
198 aa  192  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  51.1 
 
 
194 aa  180  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  64.62 
 
 
196 aa  178  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  54.81 
 
 
183 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  50.33 
 
 
230 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  53.72 
 
 
204 aa  124  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  44.22 
 
 
272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  46.62 
 
 
446 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  47.01 
 
 
377 aa  104  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  44.88 
 
 
199 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  41.89 
 
 
392 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  43.75 
 
 
238 aa  97.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  41.6 
 
 
223 aa  97.4  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  44.53 
 
 
329 aa  97.4  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  43.07 
 
 
330 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  39.86 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  46.15 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  47.32 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  42.11 
 
 
327 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  42.11 
 
 
327 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  44.44 
 
 
348 aa  87.8  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  41.35 
 
 
327 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  39.66 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  41.35 
 
 
327 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  42.11 
 
 
327 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  41.35 
 
 
327 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  41.35 
 
 
327 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  41.35 
 
 
333 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  41.35 
 
 
333 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  41.35 
 
 
327 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  43.56 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  43.56 
 
 
170 aa  84.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  40.6 
 
 
328 aa  84.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  43.56 
 
 
170 aa  84  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0813  peptidase M23B  44.37 
 
 
548 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  42.42 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  46.15 
 
 
844 aa  81.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  42.42 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  41.41 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  38.35 
 
 
442 aa  77.4  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  41.41 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  41.41 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  41.41 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  36.5 
 
 
386 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  36.72 
 
 
419 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  35.77 
 
 
386 aa  74.7  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  37.59 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  41.46 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  35.77 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  40.87 
 
 
727 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  40.87 
 
 
727 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  40.95 
 
 
389 aa  72  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  34.35 
 
 
385 aa  72  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  32.56 
 
 
470 aa  70.9  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  36.43 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  32.4 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  36.43 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  39.05 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  32.85 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  35.48 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  39.81 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  42.72 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  37.6 
 
 
581 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.45 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  36.43 
 
 
467 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  41.75 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.45 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  41.58 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40.48 
 
 
590 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  35.14 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.41 
 
 
425 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  38.68 
 
 
491 aa  69.3  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  41.41 
 
 
425 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  36.51 
 
 
402 aa  68.2  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.15 
 
 
569 aa  68.2  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  38.32 
 
 
446 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  35.24 
 
 
388 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  32.88 
 
 
341 aa  68.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  45.45 
 
 
491 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0884  Peptidase M23  34.75 
 
 
345 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00022367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  40.38 
 
 
449 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  38.89 
 
 
269 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  34.4 
 
 
646 aa  67.8  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  39.83 
 
 
457 aa  67.8  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  39.83 
 
 
457 aa  67.8  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  36.51 
 
 
490 aa  67.4  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.34 
 
 
441 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40.18 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  41.84 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  40.4 
 
 
420 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  41.51 
 
 
527 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  39.13 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  40.4 
 
 
421 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  33.79 
 
 
263 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  39.25 
 
 
824 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  40.4 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  40.4 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  36.07 
 
 
533 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  36.07 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>