More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0504 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  100 
 
 		 419 aa  822    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  61.21 
 
 		 225 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  49.59 
 
 		 569 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  49.62 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  53.66 
 
 		 464 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  50 
 
 		 480 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  50.81 
 
 		 468 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  51.18 
 
 		 695 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  48.95 
 
 		 475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  50.81 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  50 
 
 		 503 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  48.92 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  46.88 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  48.92 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  48.92 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  49.24 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  50.41 
 
 		 665 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  48.92 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  47.97 
 
 		 581 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  46.67 
 
 		 680 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  47.5 
 
 		 681 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  48.2 
 
 		 472 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  48.33 
 
 		 695 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  46.67 
 
 		 741 aa  133  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  47.97 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  47.97 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  46.67 
 
 		 687 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  47.97 
 
 		 645 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  50.41 
 
 		 533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  54.03 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  46.67 
 
 		 676 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  50.76 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  50.81 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  47.5 
 
 		 692 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  44.09 
 
 		 287 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  46.67 
 
 		 690 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  48.46 
 
 		 457 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  48.44 
 
 		 615 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  47.93 
 
 		 697 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  47.93 
 
 		 697 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  50.4 
 
 		 491 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  50.4 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  28.94 
 
 		 651 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  46.88 
 
 		 621 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  47.93 
 
 		 676 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  48.09 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  45.9 
 
 		 651 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  45.9 
 
 		 651 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  47.11 
 
 		 681 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  47.73 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  44.88 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  46.49 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  47.11 
 
 		 699 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  41.03 
 
 		 656 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  45.97 
 
 		 674 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  45.74 
 
 		 683 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  45.6 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  41.56 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  41.89 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  43.48 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  43.85 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.74 
 
 		 524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  45.16 
 
 		 646 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  43.85 
 
 		 477 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  45.52 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  48.06 
 
 		 503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  44.19 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  45.67 
 
 		 460 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  48.78 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  46.32 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  43.75 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  46.32 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  39.2 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  45.6 
 
 		 646 aa  117  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  48.12 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  26.09 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  42.19 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  47.97 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  42.36 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  41.4 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  40.67 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  48.44 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  48.28 
 
 		 299 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  42.97 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  44.2 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  44 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  42.64 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  36.51 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  51.2 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  51.2 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  43.55 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  46.77 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  39.06 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  37.04 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  40.77 
 
 		 648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  51.2 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  47.93 
 
 		 238 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  41.33 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  46.88 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  43.54 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>