More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0288 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  94.71 
 
 		 170 aa  333  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  93.53 
 
 		 170 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  87.06 
 
 		 170 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  72.94 
 
 		 170 aa  269  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  75 
 
 		 170 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  75.6 
 
 		 170 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  73.53 
 
 		 170 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  74.4 
 
 		 170 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  58.06 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  48.21 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  47.65 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  43.56 
 
 		 172 aa  84.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  39.17 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  38.33 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  38.94 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  45.92 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  42.98 
 
 		 377 aa  72.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  39.32 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  38.52 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  40.23 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  36.13 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  36.43 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  35.25 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6353  hypothetical protein  51.61 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  40.2 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  38.89 
 
 		 314 aa  61.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  34.17 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  38.64 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  36.84 
 
 		 460 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  33.33 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  33.07 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  35.96 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  29.46 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  34.21 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  31.65 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  32.95 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  36.67 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  36.78 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  33.05 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  33.33 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  30.47 
 
 		 306 aa  55.1  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  36.08 
 
 		 297 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  31.86 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  35.63 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  29.84 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  31.78 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  35.63 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  28.57 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  28.57 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  32.74 
 
 		 274 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  31.86 
 
 		 274 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  30.51 
 
 		 291 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  33.33 
 
 		 309 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  30.4 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  33.33 
 
 		 649 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  32.65 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  38.95 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  31.93 
 
 		 299 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.46 
 
 		 517 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  35.63 
 
 		 280 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.75 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  34.09 
 
 		 313 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  31.62 
 
 		 412 aa  52  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  30.77 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  33.33 
 
 		 446 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  33.64 
 
 		 281 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  36.36 
 
 		 273 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  33.64 
 
 		 281 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  35.05 
 
 		 223 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  32.98 
 
 		 669 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  32.41 
 
 		 265 aa  51.6  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  30.83 
 
 		 468 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  32.99 
 
 		 448 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  32.79 
 
 		 238 aa  51.2  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  36.44 
 
 		 302 aa  50.8  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  35.63 
 
 		 404 aa  50.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  32.61 
 
 		 271 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.94 
 
 		 321 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  31.52 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.83 
 
 		 439 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  30.07 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  36 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  29.75 
 
 		 323 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  38.2 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  31.91 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  30.16 
 
 		 266 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  34.17 
 
 		 300 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  37.93 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  31.52 
 
 		 271 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  30.39 
 
 		 336 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  34.09 
 
 		 290 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  29.91 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  31.2 
 
 		 305 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  31.91 
 
 		 824 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  31.52 
 
 		 262 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.26 
 
 		 283 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  37.08 
 
 		 316 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  36.89 
 
 		 370 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  33.65 
 
 		 433 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>