More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1590 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  100 
 
 
390 aa  806    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  49.87 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  50.26 
 
 
385 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  48.7 
 
 
386 aa  409  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  50.52 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  50.52 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  50 
 
 
386 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  46.17 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  43.68 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  46.13 
 
 
353 aa  341  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.99 
 
 
475 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  33.71 
 
 
474 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  32.66 
 
 
472 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  37.01 
 
 
475 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.94 
 
 
480 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  38.52 
 
 
523 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  33.92 
 
 
503 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  32.29 
 
 
473 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  32.29 
 
 
475 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  32.29 
 
 
473 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.08 
 
 
441 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  33.56 
 
 
417 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  37.18 
 
 
470 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  32.87 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  38.96 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  32.5 
 
 
465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  38.96 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  31.8 
 
 
503 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  31.85 
 
 
438 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  46.75 
 
 
517 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  34.22 
 
 
513 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  31.67 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  38.78 
 
 
479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.09 
 
 
741 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  35.86 
 
 
448 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  43.19 
 
 
533 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  35.91 
 
 
423 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  36.76 
 
 
435 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  32.01 
 
 
459 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.56 
 
 
490 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  29.97 
 
 
439 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  35.52 
 
 
452 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.25 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  35.47 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  27.98 
 
 
430 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  35.9 
 
 
464 aa  154  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  32.78 
 
 
406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  28.89 
 
 
490 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  34.02 
 
 
569 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  30.31 
 
 
472 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  43.79 
 
 
437 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  36.78 
 
 
457 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  30.31 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  32.03 
 
 
446 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35.09 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  31.95 
 
 
457 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  30.75 
 
 
490 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34.65 
 
 
471 aa  146  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  28.12 
 
 
462 aa  146  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  39.67 
 
 
665 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  35.47 
 
 
464 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  28.82 
 
 
477 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  45.78 
 
 
464 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.84 
 
 
421 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  39.87 
 
 
477 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  39.11 
 
 
421 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  36.53 
 
 
464 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  38.6 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  36.55 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  36.55 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  32.16 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  30.66 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  38.76 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  47.1 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  45.28 
 
 
460 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  40.57 
 
 
687 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  38.14 
 
 
420 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  31.6 
 
 
429 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  35.68 
 
 
453 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  28.49 
 
 
498 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  32.67 
 
 
440 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  33.48 
 
 
460 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  32.67 
 
 
440 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  41.48 
 
 
651 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  41.48 
 
 
651 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  29.79 
 
 
465 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.67 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  42.68 
 
 
651 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  39.63 
 
 
695 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  32.87 
 
 
470 aa  136  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  27.57 
 
 
524 aa  136  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  28.44 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  32.64 
 
 
656 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  31.64 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  34.23 
 
 
681 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  40.8 
 
 
697 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  40.8 
 
 
697 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  41.38 
 
 
699 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  40.24 
 
 
681 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  40.24 
 
 
680 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>