More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1627 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
386 aa  787    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  52.76 
 
 
388 aa  426  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  48.7 
 
 
390 aa  409  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  51.43 
 
 
389 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  47.92 
 
 
385 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  46.21 
 
 
386 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  45.95 
 
 
386 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  52.14 
 
 
353 aa  368  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  45.17 
 
 
386 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  43.44 
 
 
402 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  41.7 
 
 
475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  35.29 
 
 
503 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  33.52 
 
 
474 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.06 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.06 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.43 
 
 
470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  32.87 
 
 
475 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  32.05 
 
 
472 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  32.32 
 
 
473 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  42.49 
 
 
480 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.12 
 
 
441 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  35.25 
 
 
523 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  37.3 
 
 
569 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  31.03 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  35.38 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  33.69 
 
 
441 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  43.33 
 
 
447 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  43.33 
 
 
468 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  33.45 
 
 
517 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  45.76 
 
 
437 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  37.2 
 
 
490 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.4 
 
 
477 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  35.05 
 
 
477 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  34.43 
 
 
479 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  29.55 
 
 
448 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  38.31 
 
 
533 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.71 
 
 
470 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  34.16 
 
 
438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  39.92 
 
 
471 aa  156  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  39.92 
 
 
471 aa  156  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  30.25 
 
 
490 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  30.79 
 
 
741 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  28.62 
 
 
441 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  31.29 
 
 
472 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  36.51 
 
 
464 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  37.05 
 
 
435 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  31.6 
 
 
490 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.23 
 
 
460 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.09 
 
 
446 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  28.57 
 
 
465 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.34 
 
 
462 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  34.01 
 
 
498 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  37.44 
 
 
695 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  37.61 
 
 
423 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  35.84 
 
 
464 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  32.11 
 
 
464 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  34.96 
 
 
464 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  31.32 
 
 
434 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  28.07 
 
 
513 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  36.4 
 
 
665 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  37.16 
 
 
452 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  29.22 
 
 
468 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  29.22 
 
 
468 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  34.45 
 
 
406 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  29.22 
 
 
468 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  31.23 
 
 
465 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  29.39 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  29.34 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  29.36 
 
 
482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  28.71 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  36.4 
 
 
651 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  36.4 
 
 
651 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  34.86 
 
 
462 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  29.86 
 
 
491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  34.62 
 
 
656 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  28.69 
 
 
439 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  28.74 
 
 
468 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  33.9 
 
 
464 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  28.38 
 
 
440 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  28.38 
 
 
440 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  30.14 
 
 
430 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  28.61 
 
 
468 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  32.54 
 
 
439 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  29.91 
 
 
457 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  28.74 
 
 
466 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  33.19 
 
 
491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  31.93 
 
 
460 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  34 
 
 
651 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  26.84 
 
 
503 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  29.63 
 
 
439 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  28.86 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.22 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  29.39 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  34.36 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  30.4 
 
 
512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  30.23 
 
 
472 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  34.38 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  35.21 
 
 
362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  35.53 
 
 
454 aa  130  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  35.53 
 
 
454 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>