More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_73200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  60 
 
 
170 aa  198  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  58.54 
 
 
170 aa  197  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  58.06 
 
 
170 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  56.96 
 
 
170 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  52.47 
 
 
170 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  58.06 
 
 
178 aa  184  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  56.29 
 
 
170 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  55.63 
 
 
170 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  55.63 
 
 
170 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  54.97 
 
 
170 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  53.16 
 
 
181 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6353  hypothetical protein  85.48 
 
 
169 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  47.32 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  43.31 
 
 
194 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  46.23 
 
 
198 aa  87.8  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  48.11 
 
 
196 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  45.22 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  46.9 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  39.24 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  37.32 
 
 
377 aa  74.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  44.76 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  35.4 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  36.59 
 
 
281 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  36.59 
 
 
281 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  38.84 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  37.72 
 
 
446 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  34.45 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  37.82 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  38.24 
 
 
297 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  34.51 
 
 
295 aa  63.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  38.04 
 
 
314 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  40 
 
 
348 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  36.75 
 
 
330 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  39 
 
 
329 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  42 
 
 
328 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  38.04 
 
 
271 aa  62  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  36.96 
 
 
271 aa  61.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  37.5 
 
 
277 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  44.71 
 
 
462 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35.48 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  38.02 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  39.08 
 
 
272 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  36.78 
 
 
271 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  37.5 
 
 
300 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  44.71 
 
 
464 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  39.77 
 
 
290 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  39.5 
 
 
499 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  41 
 
 
327 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1006  Peptidase M23  34.17 
 
 
270 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  41 
 
 
327 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  34.92 
 
 
824 aa  58.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  38.24 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  35.42 
 
 
447 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  36.56 
 
 
323 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  35.42 
 
 
447 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  40 
 
 
327 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  40 
 
 
333 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  37.5 
 
 
404 aa  57.4  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  37.78 
 
 
468 aa  57.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  40 
 
 
327 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  40 
 
 
327 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  40 
 
 
327 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  38.61 
 
 
311 aa  57.8  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  40 
 
 
333 aa  57.4  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  39 
 
 
327 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  35.48 
 
 
271 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  39 
 
 
327 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  31.25 
 
 
336 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  34.34 
 
 
272 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  35.63 
 
 
294 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  37.08 
 
 
198 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.29 
 
 
491 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  34.26 
 
 
446 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  35.25 
 
 
293 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  36.96 
 
 
313 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  37.93 
 
 
465 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  37.04 
 
 
319 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  39.56 
 
 
446 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  31.82 
 
 
448 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  37.65 
 
 
446 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  32.56 
 
 
482 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  37.08 
 
 
198 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  30.84 
 
 
271 aa  55.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  39.56 
 
 
266 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  36.11 
 
 
224 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  33.03 
 
 
339 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  36.75 
 
 
512 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  39.78 
 
 
349 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  36.75 
 
 
471 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  34.91 
 
 
334 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.11 
 
 
425 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  35.87 
 
 
430 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.41 
 
 
482 aa  54.7  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  36.75 
 
 
472 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  33.02 
 
 
363 aa  54.7  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  34.78 
 
 
451 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  38.95 
 
 
288 aa  54.7  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  34.78 
 
 
455 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  37.5 
 
 
286 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>