More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4428 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  48.55 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  57.69 
 
 		 235 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  50.79 
 
 		 406 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  47.24 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  53.91 
 
 		 458 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  51.63 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  54.2 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  46.45 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  47.65 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  47.65 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  47.65 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  47.37 
 
 		 351 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  47.47 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  45.68 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  47.17 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  46.75 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  48.25 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  48.25 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  50.4 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  42.76 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  44.03 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  46.97 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.25 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  38.03 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  44.19 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  41.56 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  41.56 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  53.33 
 
 		 346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  45.97 
 
 		 348 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.4 
 
 		 590 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  49.07 
 
 		 754 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  48.25 
 
 		 727 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  48.25 
 
 		 727 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  45.45 
 
 		 452 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  46.28 
 
 		 195 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40.13 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  46.28 
 
 		 751 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.64 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  44.64 
 
 		 386 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  42.34 
 
 		 383 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  44.35 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  33.48 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  47.54 
 
 		 524 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.75 
 
 		 386 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  45.38 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.16 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  43.75 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  43.75 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  43.08 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  42.86 
 
 		 511 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 		 384 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  42.86 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  45.08 
 
 		 824 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  42.86 
 
 		 384 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  38.24 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  40.65 
 
 		 419 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  41.96 
 
 		 384 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  44.35 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  37.3 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  44.36 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  39.13 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  38.62 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  46.53 
 
 		 447 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  42.52 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  46.53 
 
 		 447 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  44.34 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  33.97 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  39.26 
 
 		 231 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.19 
 
 		 527 aa  95.5  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.84 
 
 		 321 aa  95.5  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  34.9 
 
 		 564 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  34.9 
 
 		 564 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  34.9 
 
 		 564 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  34.9 
 
 		 564 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  45.54 
 
 		 446 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  35.22 
 
 		 564 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  40.8 
 
 		 360 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  40.27 
 
 		 445 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  38.76 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  35.26 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  39.2 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  44.12 
 
 		 442 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  43.27 
 
 		 349 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  37.3 
 
 		 603 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  37.3 
 
 		 603 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.34 
 
 		 402 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  39.1 
 
 		 394 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  37.88 
 
 		 387 aa  92  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  30.1 
 
 		 363 aa  91.3  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  41.73 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  41.73 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  41.18 
 
 		 412 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  47.06 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  44.34 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  37.21 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  38.83 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  37.21 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  39.82 
 
 		 204 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  39.82 
 
 		 204 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>