More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2596 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  100 
 
 		 311 aa  610  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  97.11 
 
 		 311 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  46.79 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  52.45 
 
 		 245 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  52.24 
 
 		 199 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  56.8 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  55.74 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  56 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  57.6 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  54.47 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  54.55 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  54.55 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  53.66 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  53.72 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  53.72 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  48.41 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  51.2 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  51.22 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  51.22 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  51.22 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  48.28 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  52.85 
 
 		 351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  52.46 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  48.8 
 
 		 727 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  48.8 
 
 		 727 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  48.46 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  43.75 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  43.75 
 
 		 198 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  49.17 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  49.55 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  51.59 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  47.24 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.86 
 
 		 751 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  45.04 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  49.12 
 
 		 754 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  35.67 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  45.6 
 
 		 452 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  42.66 
 
 		 195 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  43.28 
 
 		 590 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  36.94 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  48.08 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  48.08 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.77 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  47.12 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  43.2 
 
 		 349 aa  95.9  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  40.62 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  43.07 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  42.45 
 
 		 824 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  40.54 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  40.16 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  42.98 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.94 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  45.38 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  40.6 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  44.35 
 
 		 524 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  41.73 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  43.55 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  42.28 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.1 
 
 		 248 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  45.97 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  41.5 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  49.18 
 
 		 511 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  45.9 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.93 
 
 		 527 aa  89  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  40.91 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  44.34 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  38.93 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  38.52 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  40.34 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 363 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  37.5 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.2 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  40.34 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  40.34 
 
 		 379 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 363 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  49 
 
 		 446 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  49 
 
 		 394 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 379 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  39.66 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  40.52 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.8 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  39.37 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  38.89 
 
 		 323 aa  85.9  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  41.41 
 
 		 464 aa  85.9  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  43.8 
 
 		 252 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  47.83 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  47.83 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  40.3 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  39.84 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  41.46 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  43.59 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  38.66 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>